Microbiologie Médicale

Prélèvement
Obtenir des biopsies lors d’une endoscopie : idéalement, deux biopsies, une antrale et une fundique, sont recommandées afin d’optimiser la sensibilité de détection. Ce point est particulièrement important lorsque les cultures sont réalisés pour évaluer l’efficacité d’un traitement antibiotique.
Transport
H. pylori est très sensible à la dessiccation et à l’exposition à l’oxygène (air ambiant). Le milieu de transport choisi dépendra de la durée de conservation du prélèvement avant son acheminement et sa mise en culture au laboratoire :

• Si acheminement direct au laboratoire et ensemencement possible dans les 4 heures qui suivent le prélèvement → Conservation de la biopsie dans un récipient stérile contenant 1-2 ml d’eau physiologique stérile. Le prélèvement est maintenu à 4°C.
• Si le délai d’acheminement et mise en culture au laboratoire est compris entre 4 et 24h → Conservation de la biopsie dans un milieu de transport adapté (p.ex. : Portagerm pylori, bioMérieux) maintenu à 4°C.
• Pour un délai supérieur à 24 h, → Biopsie congelée à -80°C dans un tube sec et acheminement en carboglace (ou azote liquide).

Mise en culture d'un broyat de la biopsie sur milieu sélectif approprié.
Incubation: 3 à 10 jours à 35 +/-1°C, en microaérophilie.

• L’isolement d'Helicobacter pylori nécessite la mise en place d’un traitement de l’infection ayant pour but l’éradication du microorganisme. Le protocole courant pour le traitement d’H. pylori combine l’utilisation d’un agent anti-secrétoire (inhibiteur de pompe à proton ; IPP) et d’une association comprenant deux antibiotiques parmi les trois suivants : amoxicilline, métronidazole, clarithromycine. Le traitement de premiere ligne préconise l’association d’un IPP (double dose/j) d’amoxicilline (2 x 1 g) et de clarithromycine (2 x 500 mg) pdt une durée de 7 à 14 j.
• La réalisation d’un antibiogramme s’avère nécessaire en cas d’échec du traitement instauré.