Microbiologie clinique

Conditions de prélèvements :

• Recueillir les selles dès émission dans un récipient propre.
• Prélever l’équivalent d’une noisette de selles (portion muco-purulente ou sanglante lorsqu’il en existe) à l’aide d’une spatule ou d’un flacon-cuillère puis transférer cet aliquote dans un pot stérile.

Remarques :

• Recherche de parasites : puisque l’émission des parasites est intermittente, il convient de prélever 3 échantillons de selles à des moments différents. Identifier les échantillons comme suit : « 1 sur 3 », « 2 sur 3 », « 3 sur 3 ».
• Un écouvillonnage rectal (avec présence de fèces) peut éventuellement être prélevé, notamment en pédiatrie.
• Ne jamais récolter la selle dans l’eau de la cuvette de toilette.
• Ne pas utiliser de papier toilette pour récolter les selles (le papier peut être imprégné de sels de baryum qui sont des inhibiteurs pour les microorganismes pathogènes).

Transport : 

• Le prélèvement doit être immédiatement acheminé au laboratoire, afin d’éviter la dessiccation et la prolifération des bactéries et levures commensales. 
• Si ce n’est pas possible : max. 24h au frigo. 

Conservation : 

Le prélèvement doit être immédiatement acheminé au laboratoire, afin d’éviter la dessiccation et la prolifération des bactéries et levures commensales. 
Si ce n’est pas possible : max. 24h au frigo. 

Délai d'ajout : 48H. 

Culture semi-quantitative sur milieux appropriés y compris un bouillon d'enrichissement sélectif. Incubation :  

* 18 à 42h à 35 +/- 1°C en aérobiose (recherche de Salmonella sp./ Shigella sp.), 

* 48h à 42 +/- 1°C, en microaérophilie (recherche de Campylob. 

Les bactéries entéropathogènes recherchées en routine sont les suivantes : 
Salmonella sp., Shigella sp., Campylobacter sp., Yersinia sp. 

Pour tout autre demande spécifique, telle que la recherche de Vibrio cholerae ou  d' E.coli entérohémorragique par exemple, le clinicien doit contacter un microbiologiste afin que des conditions de cultures appropriées soient mises en œuvre.