Microbiologie clinique

1. CONDITIONS DE COLLECTE

Pour le prélèvement du sang dans les flacons d’hémocultures, plusieurs paramètres sont importants :

• Volume de sang prélevé
• Nombre d’hémocultures
• Séquence de prélèvement: lorsque plusieurs analyses sont demandées lors de la même prise de sang, le sang pour les hémocultures est prélevé en premier lieu (d’abord le flacon aérobie puis le flacon anaérobie)
• Asepsie rigoureuse lors du prélèvement afin d'éviter la contamination des flacons

Lien vers la procédure de prélèvement.

2. TRANSPORT ET CONSERVATION

• Le prélèvement doit être acheminé au laboratoire dans les 2 heures (conservation à T° ambiante)
• Si ce n’est pas possible : max. 12h à T° ambiante (18-26°C), jamais au frigo.

Culture en flacon BactAlert PF PLUS (bioMérieux).
Incubation: 1 à 5 jours à 35 +/- 1°C.

Examen microscopique direct après coloration de Gram des flacons positifs.
Sous-culture des flacons positifs sur milieux appropriés.
Incubation: 24h à 35 +/- 1°C.

• La durée d'incubation des flacons d'hémoculture est de 5 jours.

• Passé ce délai, si aucune croissance n'a été observée, la culture des flacons est répondue: "NEGATIVE, pas de croissance dans les conditions appropriées."

• Si une croissance est observée en déhans les 5 jours, on procède à une sous-culture du flacon positif sur milieux appropriés, ainsi qu'à un examen microscopique après coloration de Gram, afin de caractériser l'agent étiologique présent dans le flacon d'hémoculture.

FAUX POSITIF:

• Une hémoculture positive signe généralement la présence d’une bactériémie. Cependant, les bactéries de la flore cutanée (ou de l’environnement) peuvent contaminer les flacons causant un faux-positif (pseudobactériémie). Lorsqu’une seule hémoculture (sur au moins 2 sets prélevés à la même date),isolée d’un patient non-immunodéprimé, est positive pour un de germes suivants : Staphylocoques coagulase négative, Micrococcus luteus, Bacillus sp., Corynebacterium sp., Propionibacterium sp., il convient de suspecter une contamination.

FAUX NEGATIF:

• Un certain nombre de micro-organismes fastidieux poussent difficilement (ou pas du tout) dans les flacons d’hémocultures utilisés en routine, comme les Bartonella ou les Legionella, par exemple.
• Le métabolisme de certaines bactéries pourraient ne pas produire du CO2 en quantité suffisante pour la détection des systèmes automatisés.
• Certains facteurs, comme la prise d’antibiotiques avant la collecte de l’hémoculture peut induire un échec de la culture des bactéries présentes dans le sang.