Analyses - Liste filtrée des analyses

Accréditation
Discipline
Nature de l'échantillon
Réalisable en urgence

Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Bactériologie
Code Essai	Propriété mesurée	Echantillon	Méthode et appareil
AER_SELL	SELLES - Culture aérobie d'un prélèvement de selles	Selles	Culture semi-quantitative sur milieux appropriés y compris un bouillon d'enrichissement sélectif. Incubation : * 18 à 42h à 35 +/- 1°C en aérobiose (recherche de Salmonella sp./ Shigella sp.), * 48h à 42 +/- 1°C, en microaérophilie (recherche de Campylob.
BLSES	SELLES - Recherche d'entérobactéries productrices de BLSE	Selles	Culture sur milieu sélectif différentiel approprié Incubation: 24 à 48h à 35 +/- 1°C
VRE_SELL	SELLES - Recherche d'entérocoques résistants à la vancomycine (VRE)	Selles	Culture sur milieu sélectif différentiel approprié. Incubation: 18 à 40h à 35 +/- 1°C.
CLDI	SELLES - Recherche de Clostridium difficile par culture	Selles	Culture sur milieu sélectif différentiel approprié. Incubation: 48h à 35 +/- 1°C en anaérobiose.
CPES	SELLES - Recherche de bacilles Gram négatif multi-résistants	Selles	Culture sur milieu sélectif différentiel approprié Incubation: 24 à 48h à 35 +/- 1°C
MYCE_SELL	SELLES - Recherche de champignons	Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire	Culture sur milieu approprié. Incubation: 48h à 35 +/- 1°C.
ANAG	TRACTUS GENITAL - Culture anaérobie d'un prélèvement génital	Tractus urogénital-rectal > Endocol Tractus urogénital-rectal > Prélèvement cervico-vaginal conventionnel Tractus urogénital-rectal > Sperme Tractus urogénital-rectal > Urétral Tractus urogénital-rectal > Cul de sac de Douglas Tractus urogénital-rectal > Origine génitale – Autre Tractus urogénital-rectal	Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. Incubation: de 48 h à 10 jours à 35 +/- 1°C en anaérobiose.
AER_GEN	TRACTUS GENITAL - Culture aérobie d'un prélèvement génital	Tractus urogénital-rectal > Endocol Frottis > Méat urétral Tractus urogénital-rectal > Sperme Tractus urogénital-rectal > Vaginal Tractus urogénital-rectal > Vulve Tractus urogénital-rectal > Pénis Tractus urogénital-rectal > Cul de sac de Douglas Tractus urogénital-rectal > Origine génitale – Autre	Examen microscopique direct après coloration de Gram (Calcul du score de Nugent sur prélèvement vaginal). Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. Incubation: 24 à 48h à 35 +/- 1°C.
GONCG	TRACTUS GENITAL - Culture de gonocoques sur un prélèvement génital	Tractus urogénital-rectal > Endocol Tractus urogénital-rectal > Frottis rectal Tractus urogénital-rectal > Urétral Tractus urogénital-rectal > Cul de sac de Douglas Tractus urogénital-rectal > Origine génitale – Autre Tractus urogénital-rectal	Culture semi-quantitative sur milieu sélectif approprié. Incubation: 24 à 72h à 35 +/- 1°C.
DSB	TRACTUS GENITAL - Dépistage prénatal de streptocoques du groupe B	Tractus urogénital-rectal > Frottis rectal Tractus urogénital-rectal > Vaginal Tractus urogénital-rectal > Vagino-rectal	Culture sur milieux appropriés y compris un bouillon d'enrichissement sélectif. Incubation: 24 à 48h à 35 +/- 1°C.
LEVG	TRACTUS GENITAL - Recherche de levures par culture sur un prélèvement génital	Tractus urogénital-rectal > Endocol Tractus urogénital-rectal > Frottis rectal Tractus urogénital-rectal > Prélèvement cervico-vaginal conventionnel Tractus urogénital-rectal > Sperme Tractus urogénital-rectal > Urétral Tractus urogénital-rectal > Vaginal Tractus urogénital-rectal > Vulve Tractus urogénital-rectal > Pénis Tractus urogénital-rectal > Cul de sac de Douglas Tractus urogénital-rectal > Origine génitale – Autre Tractus urogénital-rectal	Culture semi-quantitative sur milieu approprié. Incubation: 24 à 48h à 35 +/- 1°C.
AER_UR	URINE - Culture aérobie d'un prélèvement urinaire	Urines	Culture quantitative sur milieux appropriés. Incubation: 16h à 35 +/- 1°C
LEVC_UR	URINE - Recherche de levures par culture sur un prélèvement urinaire	Urines	Culture quantitative sur milieux appropriés. Incubation: 16 à 40 h à 35 +/- 1°C
LEVU	URINE - Recherche de levures par culture sur un prélèvement urinaire	Urines Urines > Urine mi-jet Urines > Urine sondée Urines > Urine – Sonde à demeure Urines > Urine – Ponction sus-pubienne Urines > Urine – Premier jet Urines > Urine – Post massage prostate Urines > Urine – Urinocol	Culture quantitative sur milieux appropriés. Incubation: 24 à 48 h à 35 +/- 1°C.

Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Biologie Moléculaire
Code Essai	Propriété mesurée	Echantillon	Méthode et appareil
PERP_AMP	Détection par PCR multiplex en temps réel des bactéries Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis et Bordetella holmesii	Voies respiratoires > Expectoration Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx	PCR multiplex en temps réel qualitative, Lightcyler 480 (Roche)
PLAP	Détection qualitative par PCR de Plasmodium sp.	Sang	PCR qualitative nichée mutiplex "in house" pour la détection de P. falciparum, P. vivax, P. ovale et P. malariae, Thermocycler classique
ASPP	Détection qualitative par PCR en temps réel d'Aspergillus sp.	Liquides biologiques Biopsie Voies respiratoires > Prélèvement du tractus respiratoire – Autre Frottis > Frottis divers	PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour l'ARNr 18S, ABI 7500 (Applied Biosystems)
BKP	Détection qualitative par PCR en temps réel de Mycobacterium tuberculosis et recherche de résistance à la rifampicine.	Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Liquides biologiques > Liquide de ponction divers Voies respiratoires > Expectoration Urines Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Tissus frais Biopsie Frottis > Frottis divers	PCR qualitative en temps réel sur GeneXpert ciblée sur le gène rpoB et sur des fragments des séquences cibles des éléments d’insertion IS1081 et IS6110 de Mycobacterium tuberculosis de manière à permettre également la détection de mutations de résistanc
BKPID	Détection qualitative par PCR en temps réel de Mycobacterium tuberculosis et recherche de résistance à la rifampicine.	Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Expectoration Urines Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire	PCR qualitative en temps réel sur GeneXpert ciblée sur le gène rpoB et sur des fragments des séquences cibles des éléments d’insertion IS1081 et IS6110 de Mycobacterium tuberculosis de manière à permettre également la détection de mutations de résistanc
MENP	Détection qualitative du méningocoque par PCR de Neisseria meningitidis (Meningocoque)	Liquides biologiques > LCR	PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour la protéine Ctra de Neisseria meningitidis, thermocycleur 7500 (ABI biosystems)

Sortie Excel