• Accréditation
  • Discipline
  • Nature de l'échantillon
  • Réalisable en urgence



Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Biologie Moléculaire
Code EssaiPropriété mesuréeEchantillonMéthode et appareil
COVIDP_ALIN, COVIDP_Cycles RT-PCR COVID-19 (Alinity) Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques
Voies respiratoires > Gorge
Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire
Voies respiratoires > Nasopharynx

PCR qualitative en temps réel, SARS-CoV-2 AMP (Abbott), Alinity (Abbott)

COVIDP_COB, COVIDP_E, COVIDP_ORF1 RT-PCR COVID-19 (Cobas) Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques
Voies respiratoires > Gorge
Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire
Voies respiratoires > Nasopharynx

PCR qualitative en temps réel, Cobas Sars-Cov2, Cobas 6800 (Roche)

COVIDP_XPERT, COVIDP_XPR_E, COVIDP_XPR_N2 RT-PCR COVID-19 urgente Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques
Voies respiratoires > Gorge
Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire
Voies respiratoires > Nasopharynx

PCR qualitative en temps réel, Xpert® Xpress SARS-CoV-2 (Cepheid), GeneXpert (Cepheid)

CMVPQ_m2000 Recherche de Cytomégalovirus (quantification par PCR) Sang

PCR quantitative en temps réel, kit Abbott RealTime CMV, m2000 (Abbott)


Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Mycoses
Code EssaiPropriété mesuréeEchantillonMéthode et appareil
MIC-CNR-MYC3 Recherche de champignons filamenteux par culture Phanères et peau > Cheveux
Phanères et peau > Ongles
Phanères et peau > Squames
Phanères et peau

Mise en culture avec isolement sur des milieux spécifiques et incubation en aérobiose

MIC-CNR-MYC2 Recherche de levures par culture Phanères et peau > Cheveux
Phanères et peau > Ongles
Phanères et peau > Squames

Mise en culture avec isolement sur des milieux spécifiques et incubation en aérobiose


Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Streptocoques
Code EssaiPropriété mesuréeEchantillonMéthode et appareil
MIC-CNR-GBS1 Recherche de S.agalactiae par culture après enrichissement sélectif Frottis > Frottis vaginal
Frottis > Frottis rectal

Culture sur milieux sélectifs et différentiels appropriés y compris un bouillon d'enrichissement sélectif. Incubation à 35°C dans les atmosphères appropriées (air, air + CO2 et anaérobiose)


Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Vibrios
Code EssaiPropriété mesuréeEchantillonMéthode et appareil
TDRHP Recherche par PCR de la présence des gènes TDH/TRH Vibrio parahaemoliticus Culture > Vibrio sp

PCR

MIC-CNR-VIB5 Recherche par PCR de la présence du gène CtxA, marqueur de pathogénicité codant pour la sous-unité A de la toxine cholérique Culture

Détection du gène CtxA par PCR "in house" en temps réel adaptée d'après l'article "Use of real time PCR assay for detection of the CtXA gene of Vibrio Cholerae in an environmental survey of mobile bay" (Blackstone G. et al., Journal of Microbiological Methods, 2007)


Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Mycobactéries
Code EssaiPropriété mesuréeEchantillonMéthode et appareil
BK Recherche de mycobactéries par culture Urines
Liquides biologiques

Culture sur milieux solide de Löwenstein jensen et sur milieux liquides (7H9), Incubateur et Mgit (Becton Dickinson)


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