- Accréditation
- Discipline
- Nature de l'échantillon
- Réalisable en urgence
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Biologie Moléculaire | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| ECHIP | Détection qualitative par PCR en temps réel d'Echinococcus granulosus/multilocularis | Liquides biologiques > Bile | PCR qualitative en temps réel "home-made" pour l'identification d'Echinococcus granulosus/multilocularis, Light-Cycler 480 (Roche) |
| CPMP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Chlamydia pneumophila et Mycoplasma pneumoniae | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel pour la détection de Chlamydia pneumophila et Mycoplasma pneumonia sur Lightcycler 480 (Roche) |
| CTRP_ALIN | Détection qualitative par PCR en temps réel de Chlamydia trachomatis | Urines Frottis > Frottis vaginal |
PCR qualitative en temps réel pour la détection de Chlamydia trachomatis sur Alinity m (Abbott) |
| LEGP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Legionella sp | Voies respiratoires | PCR qualitative en temps réel, Lightcycler 480 (Roche) |
| MUCORP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Mucorales | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel pour la détection de Mucorales sur Light-Cycler 480 (Roche) |
| MYGP_ALIN | Détection qualitative par PCR en temps réel de Mycoplasma genitalium | Urines Frottis > Frottis vaginal |
PCR qualitative en temps réel pour la détection de Mycoplasma genitalium sur Alinity m (Abbott) |
| NOCARP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Nocardia sp | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel "home-made" basée sur les gènes 16s et 23s de Nocardia sp, Light-Cycler 480 (Roche) |
| PNCYSP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Pneumocystis jirovecii | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel "home-made" ciblée sur le gène mtLSUrRNA de Pneumocystis jirovecii |
| PNEP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Streptococcus pneumoniae (Pneumocoque) | Liquides biologiques > LCR Liquides biologiques > Liquide pleural Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour la pneumolysine de Streptococcus pneumoniae, ABI 7500 (Applied Biosystems) |
| TVAG_ALIN | Détection qualitative par PCR en temps réel de Trichomonas vaginalis | Urines Frottis > Frottis vaginal |
PCR qualitative en temps réel pour la détection de Trichomonas vaginalis sur Alinity m (Abbott) |
| MONKEYP | Détection qualitative par PCR en temps réel du virus Monkeypox | Tractus urogénital-rectal > Frottis rectal Voies respiratoires > Gorge |
PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène TNFR du virus Monkeypox, Lightcycler 480 (Roche) |
| COVIDP_ALIN | Détection qualitative par PCR en temps réel du virus SARS-CoV-2 | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Gorge Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx |
Détection qualitative par PCR en temps réel du virus SARS-CoV-2 |
| COVIDP_COB | Détection qualitative par PCR en temps réel du virus SARS-CoV-2 | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Gorge Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx |
PCR semi-quantitative en temps-réel, cobas 6800 (Roche) |
| COVIDP_Xpert | Détection qualitative par PCR en temps réel du virus SARS-CoV-2 | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Gorge Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx |
PCR semi-quantitative en temps-réel, GeneXpert (Cepheid) |
| ME_PANEL | Détection qualitative par PCR en temps réel multiplex de 14 pathogènes (bactéries, virus et champignons) responsables d'infection du système nerveux central (Panel méningite/encéphalite) | Liquides biologiques | FilmArray (BioFire - BioMérieux) |
| COVIDP_Xpert2 | Détection qualitative par PCR multiplex en temps réel des virus SARS-CoV-2/RSV/FLUA et FLUB | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Gorge Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx |
PCR multiplex en temps réel qualitative, GeneXpert (Cepheid) |
| TOXOP | Détection qualitiative par PCR en temps réel de Toxoplasma sp | Sang Liquides biologiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temsp réel "in house" ciblée sur une séquence répétée non codante (529pb) de Toxoplasma gondii, ABI 7500 (Applied Biosystems) |
| VZVP | Détection qualitiative par PCR en temps réel du virus de la Varicelle et du Zona (VZV) | Liquides biologiques > LCR Frottis > Frottis divers |
PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène ORF21, du VZV, Lightcycler 480 (Roche) |
| BKVP | Détection quantitative par PCR en temps réel du BK Polyomavirus | Sang Urines |
PCR en temps réel quantitative, Lightcyler 480 (Roche) |
| CMVPQ_m2000 | Détection quantitative par PCR en temps réel du Cytomégalovirus (CMV) dans le sang | Sang | PCR CMV quantitative en temps réel sur sang total, m2000 (Abbott) |
Sortie Excel
