- Accréditation
- Discipline
- Nature de l'échantillon
- Réalisable en urgence
Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Bactériologie | |||
Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
LEVC | DISPOSITF INTRAVASCULAIRE - Culture de levures semi-quantitative d'extrémité de cathéter | Cathéters | Culture semi-quantitative (bout de cathéter roulé sur boîte), technique de Maki, sur milieux appropriés. |
LEVC | DISPOSITF INTRAVASCULAIRE - Culture de levures sur chambre implentable (PAC) | Autre | Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. |
Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Biologie Moléculaire | |||
Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
PERP_AMP | Détection par PCR multiplex en temps réel des bactéries Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis et Bordetella holmesii | Voies respiratoires > Expectoration Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx |
PCR multiplex en temps réel qualitative, Lightcyler 480 (Roche) |
PLAP | Détection qualitative par PCR de Plasmodium sp. | Sang | PCR qualitative nichée mutiplex "in house" pour la détection de P. falciparum, P. vivax, P. ovale et P. malariae, Thermocycler classique |
ASPP | Détection qualitative par PCR en temps réel d'Aspergillus sp. | Liquides biologiques Biopsie Voies respiratoires > Prélèvement du tractus respiratoire – Autre Frottis > Frottis divers |
PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour l'ARNr 18S, ABI 7500 (Applied Biosystems) |
BKP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Mycobacterium tuberculosis et recherche de résistance à la rifampicine. | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Liquides biologiques > Liquide de ponction divers Voies respiratoires > Expectoration Urines Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Tissus frais Biopsie Frottis > Frottis divers |
PCR qualitative en temps réel sur GeneXpert ciblée sur le gène rpoB et sur des fragments des séquences cibles des éléments d’insertion IS1081 et IS6110 de Mycobacterium tuberculosis de manière à permettre également la détection de mutations de résistanc |
BKPID | Détection qualitative par PCR en temps réel de Mycobacterium tuberculosis et recherche de résistance à la rifampicine. | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Expectoration Urines Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel sur GeneXpert ciblée sur le gène rpoB et sur des fragments des séquences cibles des éléments d’insertion IS1081 et IS6110 de Mycobacterium tuberculosis de manière à permettre également la détection de mutations de résistanc |
MENP | Détection qualitative du méningocoque par PCR de Neisseria meningitidis (Meningocoque) | Liquides biologiques > LCR | PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour la protéine Ctra de Neisseria meningitidis, thermocycleur 7500 (ABI biosystems) |
LRTI_PANEL | Détection qualitative et semi-quantitative par PCR en temps réel multiplex de 33 pathogènes (virus, bactéries + résistance à certains antibiotiques) responsables d'infection des voies respiratoires basses (Panel respiratoire bas) | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
FilmArray (BioFire - BioMérieux) |
ACANTP | Détection qualitative par PCR en temps réel d'Acantamoeba keratitis | Frottis > Oeil | PCR qualitative en temps réel "home made" ciblée sur le gène codant pour la petite sous-unité ribosomiale d'Acantamoeba keratitis, Light-Cycler 480 (Roche)PCR qualitative en temps réel "home made" ciblée sur le gène codant pour la petite sous-unité riboso |