• Accréditation
  • Discipline
  • Nature de l'échantillon
  • Réalisable en urgence



Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Bactériologie
Code EssaiPropriété mesuréeEchantillonMéthode et appareil
LEVC DISPOSITF INTRAVASCULAIRE - Culture de levures semi-quantitative d'extrémité de cathéter Cathéters

Culture semi-quantitative (bout de cathéter roulé sur boîte), technique de Maki, sur milieux appropriés.
Incubation: 24 à 48 h à 35+/-1°C.

LEVC DISPOSITF INTRAVASCULAIRE - Culture de levures sur chambre implentable (PAC) Autre

Culture semi-quantitative sur milieux appropriés.
Incubation: 24 à 48 h à 35+/-1°C.


Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Biologie Moléculaire
Code EssaiPropriété mesuréeEchantillonMéthode et appareil
PERP_AMP Détection par PCR multiplex en temps réel des bactéries Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis et Bordetella holmesii Voies respiratoires > Expectoration
Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire
Voies respiratoires > Nasopharynx

PCR multiplex en temps réel qualitative, Lightcyler 480 (Roche)

PLAP Détection qualitative par PCR de Plasmodium sp. Sang

PCR  qualitative nichée mutiplex "in house" pour la détection de P. falciparum, P. vivax, P. ovale et P. malariae, Thermocycler classique 

ASPP Détection qualitative par PCR en temps réel d'Aspergillus sp. Liquides biologiques
Biopsie
Voies respiratoires > Prélèvement du tractus respiratoire – Autre
Frottis > Frottis divers

PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour l'ARNr 18S, ABI 7500 (Applied Biosystems)

BKP Détection qualitative par PCR en temps réel de Mycobacterium tuberculosis et recherche de résistance à la rifampicine. Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques
Liquides biologiques > Liquide de ponction divers
Voies respiratoires > Expectoration
Urines
Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire
Tissus frais
Biopsie
Frottis > Frottis divers

PCR qualitative en temps réel sur GeneXpert ciblée sur le gène rpoB et sur des fragments des séquences cibles des éléments d’insertion IS1081 et IS6110 de Mycobacterium  tuberculosis de manière à permettre également la détection de mutations de  résistanc

BKPID Détection qualitative par PCR en temps réel de Mycobacterium tuberculosis et recherche de résistance à la rifampicine. Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques
Voies respiratoires > Expectoration
Urines
Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire

PCR qualitative en temps réel sur GeneXpert ciblée sur le gène rpoB et sur des fragments des séquences cibles des éléments d’insertion IS1081 et IS6110 de Mycobacterium  tuberculosis de manière à permettre également la détection de mutations de  résistanc

MENP Détection qualitative du méningocoque par PCR de Neisseria meningitidis (Meningocoque) Liquides biologiques > LCR

PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour la protéine Ctra de Neisseria meningitidis, thermocycleur 7500 (ABI biosystems)

LRTI_PANEL Détection qualitative et semi-quantitative par PCR en temps réel multiplex de 33 pathogènes (virus, bactéries + résistance à certains antibiotiques) responsables d'infection des voies respiratoires basses (Panel respiratoire bas) Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques
Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire

FilmArray (BioFire - BioMérieux)

ACANTP Détection qualitative par PCR en temps réel d'Acantamoeba keratitis Frottis > Oeil

PCR qualitative en temps réel "home made" ciblée sur le gène codant pour la petite sous-unité ribosomiale d'Acantamoeba keratitis, Light-Cycler 480 (Roche)PCR qualitative en temps réel "home made" ciblée sur le gène codant pour la petite sous-unité riboso


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