- Accréditation
- Discipline
- Nature de l'échantillon
- Réalisable en urgence
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Bactériologie | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| ANAL | LIQUIDE DE ... - Culture anaérobie d'un liquide de ... | Liquides biologiques | Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. |
| AERL | LIQUIDE DE ... - Culture aérobie d'un liquide de ... | Liquides biologiques | Examen microscopique direct après coloration de Gram. |
| MYCL | LIQUIDE DE ... - Recherche de champignons par culture sur un liquide de... | Liquides biologiques | Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. Incubation: 1 à 7 jours à 35 +/- 1°C. Remarque: recherche de champignons (spores et filaments mycéliens) par examen microscopique direct après coloration au calcofluor (sur demande expresse du clinicien). |
| ANAD | MATÉRIEL (autres que dispositifs intra-vasculaires) - Culture anaérobie d'un matériel | Autre | Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. |
| AERD | MATÉRIEL (autres que dispositifs intra-vasculaires) - Culture aérobie d'un matériel | Autre | Examen microscopique direct après coloration de Gram. Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. |
| MYCD | MATÉRIEL (autres que dispositifs intra-vasculaires) - Recherche de champignons par culture sur un matériel | Autre | Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. Remarque: recherche de champignons (spores et filaments mycéliens) par examen microscopique direct après coloration au calcofluor (sur demande expresse du clinicien). |
| MRSAFR | NEZ - Recherche de S.aureus oxacilline résistant (MRSA) | Voies respiratoires > Nez | Culture sur milieu sélectif différentiel. |
| ANAD | PUS DE ... - Culture anaérobie d'un pus de ... | Autres Types d'échantillons > Pus (ponction/aspiration OU biopsie) | Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. |
| AERD | PUS DE ... - Culture aérobie d'un pus de ... | Autres Types d'échantillons > Pus (ponction/aspiration OU biopsie) | Examen microscopique direct après coloration de Gram. |
| MYCD | PUS DE ... - Recherche de champignons par culture sur un pus de ... | Autres Types d'échantillons > Pus (ponction/aspiration OU biopsie) | Culture sur milieux appropriés. Incubation: 1 à 10 jours à 35 +/- 1°C. Remarque: recherche de champignons (spores et filaments mycéliens) par examen microscopique direct après coloration au calcofluor (sur demande expresse du clinicien). |
| ANAR | RESPIRATOIRE - Culture anaérobie d'un prélèvement respiratoire | Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire | Culture quantitative sur milieux appropriés. |
| AER_RESP | RESPIRATOIRE - Culture aérobie d'un prélèvement respiratoire | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
Examen microscopique direct après coloration de Gram (Score de Bartlett). Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. Incubation: 24 à 48 h à 35 +/- 1°C. |
| LEGIR | RESPIRATOIRE - Recherche de Legionella par culture | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Expectoration Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
Culture sur milieu sélectif différentiel approprié. |
| MRSAR | RESPIRATOIRE - Recherche de S.aureus oxacilline résistant (MRSA) | Voies respiratoires > Expectoration | Culture sur milieu séléctif différentiel. |
| MYCR | RESPIRATOIRE - Recherche de champignons par culture sur un prélèvement respiratoire | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Expectoration Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
Recherche de champignons (spores et filaments mycéliens) par examen microscopique direct après coloration au calcofluor (seulement sur LBA). |
| ANAH | SANG - Hémoculture (culture anaérobie) | Sang Sang > Sang par cathéter (hémoculture) Sang > Sang par ponction (hémoculture) |
Culture en flacon BactAlert FN PLUS (bioMérieux). Examen microscopique direct après coloration de Gram des flacons positifs. |
| AER_HEMOC | SANG - Hémoculture (culture aérobie) | Sang | Culture en flacon BactAlert FA PLUS (bioMérieux). Incubation: max 5 jours à 35 +/- 1°C. Examen microscopique direct après coloration de Gram des flacons positifs. Sous-culture des flacons positifs sur milieux appropriés. |
| MYCH | SANG - Hémoculture (recherche de champignons par culture) | Sang Sang > Sang par cathéter (hémoculture) Sang > Sang par ponction (hémoculture) |
Culture en flacon BactAlert FA PLUS (bioMérieux). Examen microscopique direct après coloration de Gram des flacons positifs. |
| AERHP | SANG - Hémoculture pédiatrique (culture aérobie et recherche de champignons) | Sang Sang > Sang par cathéter (hémoculture) Sang > Sang par ponction (hémoculture) |
Culture en flacon BactAlert PF PLUS (bioMérieux). Examen microscopique direct après coloration de Gram des flacons positifs. |
| AER_SELL | SELLES - Culture aérobie d'un prélèvement de selles | Selles | Culture semi-quantitative sur milieux appropriés y compris un bouillon d'enrichissement sélectif. Incubation : * 18 à 42h à 35 +/- 1°C en aérobiose (recherche de Salmonella sp./ Shigella sp.), * 48h à 42 +/- 1°C, en microaérophilie (recherche de Campylob. |
| BLSES | SELLES - Recherche d'entérobactéries productrices de BLSE | Selles | Culture sur milieu sélectif différentiel approprié |
| VRE_SELL | SELLES - Recherche d'entérocoques résistants à la vancomycine (VRE) | Selles | Culture sur milieu sélectif différentiel approprié. Incubation: 18 à 40h à 35 +/- 1°C. |
| CLDI | SELLES - Recherche de Clostridium difficile par culture | Selles | Culture sur milieu sélectif différentiel approprié. |
| CPES | SELLES - Recherche de bacilles Gram négatif multi-résistants | Selles | Culture sur milieu sélectif différentiel approprié |
| MYCE_SELL | SELLES - Recherche de champignons | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
Culture sur milieu approprié. Incubation: 48h à 35 +/- 1°C. |
| ANAG | TRACTUS GENITAL - Culture anaérobie d'un prélèvement génital | Tractus urogénital-rectal > Endocol Tractus urogénital-rectal > Prélèvement cervico-vaginal conventionnel Tractus urogénital-rectal > Sperme Tractus urogénital-rectal > Urétral Tractus urogénital-rectal > Cul de sac de Douglas Tractus urogénital-rectal > Origine génitale – Autre Tractus urogénital-rectal |
Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. |
| AER_GEN | TRACTUS GENITAL - Culture aérobie d'un prélèvement génital | Tractus urogénital-rectal > Endocol Frottis > Méat urétral Tractus urogénital-rectal > Sperme Tractus urogénital-rectal > Vaginal Tractus urogénital-rectal > Vulve Tractus urogénital-rectal > Pénis Tractus urogénital-rectal > Cul de sac de Douglas Tractus urogénital-rectal > Origine génitale – Autre |
Examen microscopique direct après coloration de Gram (Calcul du score de Nugent sur prélèvement vaginal). Culture semi-quantitative sur milieux appropriés. Incubation: 24 à 48h à 35 +/- 1°C. |
| GONCG | TRACTUS GENITAL - Culture de gonocoques sur un prélèvement génital | Tractus urogénital-rectal > Endocol Tractus urogénital-rectal > Frottis rectal Tractus urogénital-rectal > Urétral Tractus urogénital-rectal > Cul de sac de Douglas Tractus urogénital-rectal > Origine génitale – Autre Tractus urogénital-rectal |
Culture semi-quantitative sur milieu sélectif approprié. |
| DSB | TRACTUS GENITAL - Dépistage prénatal de streptocoques du groupe B | Tractus urogénital-rectal > Frottis rectal Tractus urogénital-rectal > Vaginal Tractus urogénital-rectal > Vagino-rectal |
Culture sur milieux appropriés y compris un bouillon d'enrichissement sélectif. |
| LEVG | TRACTUS GENITAL - Recherche de levures par culture sur un prélèvement génital | Tractus urogénital-rectal > Endocol Tractus urogénital-rectal > Frottis rectal Tractus urogénital-rectal > Prélèvement cervico-vaginal conventionnel Tractus urogénital-rectal > Sperme Tractus urogénital-rectal > Urétral Tractus urogénital-rectal > Vaginal Tractus urogénital-rectal > Vulve Tractus urogénital-rectal > Pénis Tractus urogénital-rectal > Cul de sac de Douglas Tractus urogénital-rectal > Origine génitale – Autre Tractus urogénital-rectal |
Culture semi-quantitative sur milieu approprié. |
| AER_UR | URINE - Culture aérobie d'un prélèvement urinaire | Urines | Culture quantitative sur milieux appropriés. Incubation: 16h à 35 +/- 1°C |
| LEVC_UR | URINE - Recherche de levures par culture sur un prélèvement urinaire | Urines | Culture quantitative sur milieux appropriés. Incubation: 16 à 40 h à 35 +/- 1°C |
| LEVU | URINE - Recherche de levures par culture sur un prélèvement urinaire | Urines Urines > Urine mi-jet Urines > Urine sondée Urines > Urine – Sonde à demeure Urines > Urine – Ponction sus-pubienne Urines > Urine – Premier jet Urines > Urine – Post massage prostate Urines > Urine – Urinocol |
Culture quantitative sur milieux appropriés. |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Biologie Moléculaire | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| PERP_AMP | Détection par PCR multiplex en temps réel des bactéries Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis et Bordetella holmesii | Voies respiratoires > Expectoration Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx |
PCR multiplex en temps réel qualitative, Lightcyler 480 (Roche) |
| PLAP | Détection qualitative par PCR de Plasmodium sp. | Sang | PCR qualitative nichée mutiplex "in house" pour la détection de P. falciparum, P. vivax, P. ovale et P. malariae, Thermocycler classique |
| ASPP | Détection qualitative par PCR en temps réel d'Aspergillus sp. | Liquides biologiques Biopsie Voies respiratoires > Prélèvement du tractus respiratoire – Autre Frottis > Frottis divers |
PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour l'ARNr 18S, ABI 7500 (Applied Biosystems) |
| BKP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Mycobacterium tuberculosis et recherche de résistance à la rifampicine. | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Liquides biologiques > Liquide de ponction divers Voies respiratoires > Expectoration Urines Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Tissus frais Biopsie Frottis > Frottis divers |
PCR qualitative en temps réel sur GeneXpert ciblée sur le gène rpoB et sur des fragments des séquences cibles des éléments d’insertion IS1081 et IS6110 de Mycobacterium tuberculosis de manière à permettre également la détection de mutations de résistanc |
| BKPID | Détection qualitative par PCR en temps réel de Mycobacterium tuberculosis et recherche de résistance à la rifampicine. | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Expectoration Urines Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel sur GeneXpert ciblée sur le gène rpoB et sur des fragments des séquences cibles des éléments d’insertion IS1081 et IS6110 de Mycobacterium tuberculosis de manière à permettre également la détection de mutations de résistanc |
| MENP | Détection qualitative du méningocoque par PCR de Neisseria meningitidis (Meningocoque) | Liquides biologiques > LCR | PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour la protéine Ctra de Neisseria meningitidis, thermocycleur 7500 (ABI biosystems) |
| LRTI_PANEL | Détection qualitative et semi-quantitative par PCR en temps réel multiplex de 33 pathogènes (virus, bactéries + résistance à certains antibiotiques) responsables d'infection des voies respiratoires basses (Panel respiratoire bas) | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
FilmArray (BioFire - BioMérieux) |
| ACANTP | Détection qualitative par PCR en temps réel d'Acantamoeba keratitis | Frottis > Oeil | PCR qualitative en temps réel "home made" ciblée sur le gène codant pour la petite sous-unité ribosomiale d'Acantamoeba keratitis, Light-Cycler 480 (Roche)PCR qualitative en temps réel "home made" ciblée sur le gène codant pour la petite sous-unité riboso |
| ECHIP | Détection qualitative par PCR en temps réel d'Echinococcus granulosus/multilocularis | Liquides biologiques > Bile | PCR qualitative en temps réel "home-made" pour l'identification d'Echinococcus granulosus/multilocularis, Light-Cycler 480 (Roche) |
| CPMP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Chlamydia pneumophila et Mycoplasma pneumoniae | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel pour la détection de Chlamydia pneumophila et Mycoplasma pneumonia sur Lightcycler 480 (Roche) |
| CTRP_ALIN | Détection qualitative par PCR en temps réel de Chlamydia trachomatis | Urines Frottis > Frottis vaginal |
PCR qualitative en temps réel pour la détection de Chlamydia trachomatis sur Alinity m (Abbott) |
| LEGP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Legionella sp | Voies respiratoires | PCR qualitative en temps réel, Lightcycler 480 (Roche) |
| MUCORP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Mucorales | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel pour la détection de Mucorales sur Light-Cycler 480 (Roche) |
| MYGP_ALIN | Détection qualitative par PCR en temps réel de Mycoplasma genitalium | Urines Frottis > Frottis vaginal |
PCR qualitative en temps réel pour la détection de Mycoplasma genitalium sur Alinity m (Abbott) |
| NOCARP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Nocardia sp | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel "home-made" basée sur les gènes 16s et 23s de Nocardia sp, Light-Cycler 480 (Roche) |
| PNCYSP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Pneumocystis jirovecii | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel "home-made" ciblée sur le gène mtLSUrRNA de Pneumocystis jirovecii |
| PNEP | Détection qualitative par PCR en temps réel de Streptococcus pneumoniae (Pneumocoque) | Liquides biologiques > LCR Liquides biologiques > Liquide pleural Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour la pneumolysine de Streptococcus pneumoniae, ABI 7500 (Applied Biosystems) |
| TVAG_ALIN | Détection qualitative par PCR en temps réel de Trichomonas vaginalis | Urines Frottis > Frottis vaginal |
PCR qualitative en temps réel pour la détection de Trichomonas vaginalis sur Alinity m (Abbott) |
| MONKEYP | Détection qualitative par PCR en temps réel du virus Monkeypox | Tractus urogénital-rectal > Frottis rectal Voies respiratoires > Gorge |
PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène TNFR du virus Monkeypox, Lightcycler 480 (Roche) |
| COVIDP_ALIN | Détection qualitative par PCR en temps réel du virus SARS-CoV-2 | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Gorge Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx |
Détection qualitative par PCR en temps réel du virus SARS-CoV-2 |
| COVIDP_COB | Détection qualitative par PCR en temps réel du virus SARS-CoV-2 | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Gorge Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx |
PCR semi-quantitative en temps-réel, cobas 6800 (Roche) |
| COVIDP_Xpert | Détection qualitative par PCR en temps réel du virus SARS-CoV-2 | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Gorge Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx |
PCR semi-quantitative en temps-réel, GeneXpert (Cepheid) |
| ME_PANEL | Détection qualitative par PCR en temps réel multiplex de 14 pathogènes (bactéries, virus et champignons) responsables d'infection du système nerveux central (Panel méningite/encéphalite) | Liquides biologiques | FilmArray (BioFire - BioMérieux) |
| COVIDP_Xpert2 | Détection qualitative par PCR multiplex en temps réel des virus SARS-CoV-2/RSV/FLUA et FLUB | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Voies respiratoires > Gorge Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx |
PCR multiplex en temps réel qualitative, GeneXpert (Cepheid) |
| TOXOP | Détection qualitiative par PCR en temps réel de Toxoplasma sp | Sang Liquides biologiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temsp réel "in house" ciblée sur une séquence répétée non codante (529pb) de Toxoplasma gondii, ABI 7500 (Applied Biosystems) |
| VZVP | Détection qualitiative par PCR en temps réel du virus de la Varicelle et du Zona (VZV) | Liquides biologiques > LCR Frottis > Frottis divers |
PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène ORF21, du VZV, Lightcycler 480 (Roche) |
| BKVP | Détection quantitative par PCR en temps réel du BK Polyomavirus | Sang Urines |
PCR en temps réel quantitative, Lightcyler 480 (Roche) |
| CMVPQ_m2000 | Détection quantitative par PCR en temps réel du Cytomégalovirus (CMV) dans le sang | Sang | PCR CMV quantitative en temps réel sur sang total, m2000 (Abbott) |
| CMVP | Détection semi-quantitative par PCR en temps réel du Cytomégalovirus (CMV) | Autres Types d'échantillons > ADN Liquides biologiques > Liquide amniotique Liquides biologiques > Liquide de ponction divers Liquides biologiques > Liquide œil Liquides biologiques > Liquide péricardique Liquides biologiques > Liquide péritonéal Liquides biologiques > Liquide pleural Organes > Placenta/Curetage (Fausse-couche) Urines Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Biopsie |
PCR qualitative en temps réel pour la détection du CMV, Lightcycler 480 (Roche) |
| NGOP_ALIN | PCR qualitative en temps réel pour la détection de Neisseria gonorrhoeae sur Alinity m (Abbott) | Urines Frottis > Frottis vaginal |
PCR qualitative en temps réel pour la détection de Neisseria gonorrhoeae sur Alinity m (Abbott) |
| HSVP | PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour la glycoprotéine D de HSV 1 et 2, ABI 7500 (Applied Biosystems) | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Liquides biologiques > Liquide de ponction divers Biopsie Frottis > Frottis divers |
Détection qualitative par PCR en temps réel des virus Herpes Simplex 1 et 2 (HSV1 et HSV2) |
| 16sP | PCR toutes bactéries | Sang Urines Culture Divers |
PCR classique ciblée sur la région V1-V3 du gène codant pour l'ARN ribosomial 16s et séquençage Sanger |
| GIPanel | Panel gastro-intestinal | Selles | FilmArray (BioFire - BioMérieux) |
| HBVP_ALIN | Test de quantification de l'ADN viral HBV plasmatique | Sang | PCR quantitative en temps réel |
| HCVP_ALIN | Test de quantification de l'ARN viral HCV plasmatique | Sang | Extraction automatisée des acides nucléiques suivie d'une amplification et d'une quantification par RT-PCR en temps réel (Alinity m, Abbott) |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Mycoses | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| MIC-CNR-MYC1 | Examen microscopique pour la détection de la présence de levures, spores et filaments mycéliens | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Ongles Phanères et peau > Squames |
Examen microscopique après coloration au blanc de calcofluor |
| MIC-CNR-MYC6 | Identification microscopique | Culture | Examen microscopique après croissance sur des milieux appropriés |
| MIC-CNR-MYC4 | Identification par détermination du profil des protéines ribosomales | Culture | Spectrométrie de masse MALDI-TOF |
| MIC-CNR-MYC7 | Identification par séquençage de la portion ITS | Culture > Levures Culture > Champignons filamenteux Tissus frais |
Technique d'amplification par PCR d'un fragment ITS permettant l'identification de l'agent fongique étudié et la discrimination entre espèces proches phylogénétiquement. |
| MIC-CNR-MYC3 | Recherche de champignons filamenteux par culture | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Ongles Phanères et peau > Squames Phanères et peau |
Mise en culture avec isolement sur des milieux spécifiques et incubation en aérobiose |
| MIC-CNR-MYC2 | Recherche de levures par culture | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Ongles Phanères et peau > Squames |
Mise en culture avec isolement sur des milieux spécifiques et incubation en aérobiose |
| MIC-CNR-MYC8 | Sensibilité aux antifongiques: détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI en mg/L) par méthode de dilution en milieu liquide et interprétation | Culture > Levures | Technique quantitative standardisée de détermination de CMI en microdilution par l'utilisation de microplaque SENSITITRE. Les suspensions standardisées de levures sont distribuées dans les microplaques à l'aide de l'autoinoculateur sensititre. Après incubation, les CMI sont lues à l'aide du système Sensititre VIZION et interprétées en catégories S (Sensible), I (Intermédiaire) et R (Résistant) en accord avec l'édition la plus récente du CLSI (Clinical Laboartory Standards Institute) |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Streptocoques | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| MIC-CNR-GBS2 | Culture | Culture | Culture sur milieux solides nutritifs ou différentiels ou en bouil'on suivant les objectifs poursuivis |
| MIC-CNR-VIB1 | Culture | Culture | Culture sur milieux solides nutritifs |
| MIC-CNR-GBS7 | Détermination de la sensibilité aux agents antimicrobiens | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Plusieurs méthodes peuvent être utilisées isolément ou en combinaison: -Détermination des concentrations minimales (CMI en mg/L) par la micro-méthode en dilution: Sensititre Trek et interpretation -Détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI en mg/L) par la méthode en dilution ETest et interprétation -Détermination de la résistance inductible à la clindamycine par la méthode de diffusion de disques en milieu gélosé |
| MIC-CNR-GBS6 | Détermination des caractéristiques microscopiques après coloration de Gram | Culture > Bactéries Culture |
Examen microscopique après coloration de Gram d'un étalement de la souche cultivée et description de la morphologie / coloration des bactéries observées |
| MIC-CNR-GBS5 | Détermination des sérotypes capsulaires de S.agalactiae | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Détection des polysaccharides capsulaires (Ia, Ib, II à IX) de S.agalactiae par un test d'agglutination avec des particules de latex spécifiques des différents sérotypes |
| MIC-CNR-VIB4 | Détermination du sérogroupe et serovar de V.cholerae | Culture | Détection des antigènes O de V.cholerae par un test d'agglutination rapide sur lame avec des antisera spécifiques de V.cholerae. |
| HEPID | HELICOBACTER PYLORI - Recherche d'Helicobacter pylori par culture | Autre | Mise en culture d'un broyat de la biopsie sur milieu sélectif approprié. |
| MIC-CNR-GBS3 | Identification de S. agalactiae par agglutination | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Détection de l'antigène de groupe B par un test d'agglutination'avec des particules de latex spécifiques du groupe B |
| MIC-CNR-VIB3 | Identification par détermination du profil des protéines ribosamales | Culture | Spectrométrie de masse MALDI-TOF |
| MIC-CNR-GBS4 | Identification par détermination du profil des protéines ribosomales | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Spectrométrie de masse MALDI-TOF |
| MIC-CNR-GBS1 | Recherche de S.agalactiae par culture après enrichissement sélectif | Frottis > Frottis vaginal Frottis > Frottis rectal |
Culture sur milieux sélectifs et différentiels appropriés y compris un bouillon d'enrichissement sélectif. Incubation à 35°C dans les atmosphères appropriées (air, air + CO2 et anaérobiose) |
| TDRHP | Recherche par PCR de la présence des gènes TDH/TRH Vibrio parahaemoliticus | Culture > Vibrio sp | PCR |
| MIC-CNR-VIB5 | Recherche par PCR de la présence du gène CtxA, marqueur de pathogénicité codant pour la sous-unité A de la toxine cholérique | Culture | Détection du gène CtxA par PCR "in house" en temps réel adaptée d'après l'article "Use of real time PCR assay for detection of the CtXA gene of Vibrio Cholerae in an environmental survey of mobile bay" (Blackstone G. et al., Journal of Microbiological Methods, 2007) |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Laboratoire de Référence SIDA > LRS : Biologie Moléculaire | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| LRS_HIV_PCR | Détection de l'ADN proviral HIV-1 dans les PBMC | Sang | Détection par PCR. Test "home-made". |
| LRS_HIV_GENO | Génotypage HIV | Sang > Plasma EDTA | Séquençage des gène Reverse Transcriptase, Protease et Integrase |
| LRS_HCV_GENO | Test de génotypage LIPA VERSANT HCV (SIEMENS) | Sang | Amplification de l'ARN viral par PCR après extraction manuelle (QIAGEN) et détermination des génotypes (de 1 à 6) et sous-types par hybridation inverse sur bandelettes |
| LRS_HBV_QUA | Test de quantification de l'ADN viral HBV plasmatique | Sang | Extraction automatisée des échantillons (m2000sp, Abbott) suivie d'une amplification et d'une quantification par PCR en temps réel (m2000rt, Abbott) |
| LRS_HCVQUAm2000RT | Test de quantification de l'ARN viral HCV plasmatique | Sang | Extraction automatisée des échantillons (m2000sp, Abbott) suivie d'une amplification et d'une quantification par RT-PCR en temps réel (m2000rt, Abbott) |
| HIVP_COB | Test de quantification de l'ARN viral HIV-1 plasmatique | Sang | Extraction automatisée des échantillons suivie d'une amplification et d'une quantification par PCR en temps réel (c6800, Roche) |
| LRS_HCVCALm2000RT | Test qualitatif de détection de l'ARN viral HCV plasmatique | Sang | Extraction automatisée des échantillons (m2000sp, Abbott) suivie d'une amplification et d'une détection par RT-PCR en temps réel (m2000rt, Abbott) |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Laboratoire de Référence SIDA > LRS : Sérologie | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| LRS_VIDAS_DUO | Test de détection de l'Ag p24 de HIV-1 et des Ac anti-HIV-1/HIV-2 dans le sang | Sang | ELFA (Enzyme Linked Fluorescent Assay, Biomerieux) réalisé sur VIDAS |
| LRS_GENS_HIV | Test qualitatif de détection d'anticorps anti-HIV1 et -HIV2 | Sang | EIA réalisé avec le test GENSCREEN HIV1/2 (v.02) (BIORAD) |
| LRS_LIA_HIV | Test qualitatif de détection d’anticorps dirigés contre le virus de l’immunodéficience humaine (HIV) de types 1 et 2 dans le sang | Sang | Immunoblot sur bandelettes réalisé sur AUTO-LIA (Innogenetics) |
| LRS_VIDAS_AGP24 | Test quantitatif de détection de l'Ag p24 de HIV-1 dans le sang | Sang | ELFA (Enzyme Linked Fluorescent Assay, Biomerieux) réalisé sur VIDAS |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Mycobactéries | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| ATBMGIT | Détermination de la sensibilité in vitro de M. tuberculosis complexe | Voies respiratoires | Sensibilité in vitro en tube MGIT (Becton Dickinson) selon la technique recommandée par le laboratoire BD, Automate d'incubation et lecture MGIT (BD) |
| BK | Recherche de mycobactéries par culture | Urines Liquides biologiques |
Culture sur milieux solide de Löwenstein jensen et sur milieux liquides (7H9), Incubateur et Mgit (Becton Dickinson) |
| EDBK | Recherche microscopique de bacilles acido-alcoolorésistants dans le LCR | Liquides biologiques > LCR | Coloration fluorescente à l'auramine, mirostainer (automate de coloration), microscope à fluorescence |
| EDBK | Recherche microscopique de bacilles acidoalcoolorésistants | Liquides biologiques > LCR Liquides biologiques > Liquide de ponction divers Liquides biologiques > Liquide gastrique Liquides biologiques > Liquide œil Liquides biologiques > Liquide péricardique Liquides biologiques > Liquide pleural Voies respiratoires > Expectoration Urines Biopsie > Ganglions Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Tissus frais Biopsie Moëlle hématopoïétique Frottis Autre Frottis > Frottis divers |
Coloration fluorescente à l'auramine et coloration de Ziehl, microscope optique |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Mycologie | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| ATF | Détermination de la sensibilité in vitro des levures provenant de sites normalement stériles | Autre | Sensibilité in vitro en milieu liquide, incubateur à 37°C. |
| MYCE | Identification des champignons filamenteux | Autre | Examen microscopique et repiquage sur milieux spéciaux, microscope optique et incubateur à 30°C |
| DERC | Identification des champignons filamenteux à partir d'une culture de la peau et des phanères | Autre | Examen microscopique et repiquage sur milieux spéciaux, microscope optique |
| LEVC | Identification des levures à l'exclusion de C. albicans | Autre | Spectrométre de masse (maldi-Tof) ou galeries d'identification |
| MYCE | Recherche de champignon filamenteux par culture | Autres Types d'échantillons | Culture sur milieu de Sabouraud additionné d'antibiotiques |
| DERC | Recherche de champignon filamenteux par culture à partir de la peau et des phanères | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Peau Biopsie Autres Types d'échantillons Frottis Autre Frottis > Frottis divers |
Culture sur milieu de Sabouraud additionné d'antibiotiques, incubateur à 30°C. |
| LEVC | Recherche de levures par culture | Urines Autres Types d'échantillons |
Culture sur milieu de Sabouraud additionné d'antibiotiques |
| EDMYCE | Recherche microscopique d'éléments fongiques (spores, filaments, pseudofilaments) | Phanères et peau > Cheveux Liquides biologiques > LCR Liquides biologiques > Liquide de ponction divers Liquides biologiques > Liquide pleural Phanères et peau > Peau Voies respiratoires > Expectoration Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Autres Types d'échantillons Moëlle hématopoïétique Organes Frottis Frottis > Frottis divers |
Coloration au Calcofluor, microscope à fluorescence avec filtre 2B |
| CHINE | Recherche microscopique de cryptocoque après coloration à l'encre de chine | Liquides biologiques > LCR Autres Types d'échantillons |
Coloration à l'encre de chine, microscope optique |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Parasitologie | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| PAR | Examen parasitologique d'un prélèvement en dehors des selles et du sang | Phanères et peau > Cheveux Liquides biologiques > LCR Liquides biologiques > Liquide de ponction divers Liquides biologiques > Liquide œil Phanères et peau > Peau Voies respiratoires > Expectoration Urines Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Tissus frais Biopsie Moëlle hématopoïétique Frottis > Frottis divers |
Coloration de May Grünwald Giemsa, microscope optique |
| PARSELLES | Examen parasitologique des selles après enrichissement | Selles | Concentration diphasique, Centrifugeuse et vortex |
| PARSG | Examen parasitologique du sang | Sang | Coloration de May Grünwald Giemsa, microscope optique sur frottis de sang et goutte épaisse |
| PLAF | Recherche d'antigène de Plasmodium falciparum | Sang | Coloration |
| PLAS | Recherche d'antigène de Plasmodium species | Sang | Test rapide immunochromatographie |
| CRYP | Recherche de cryptosporidies dans les selles | Selles | Microscope optique, Ziehl Neelsen modifiée |
| MIS | Recherche de microsporidies | Biopsie Selles |
Coloration de Weber modifiée, microscope optique |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Sérologie Infectieuse | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| ADA | Adénovirus (Recherche d'antigène) | Selles | Détection qualitative par méthode immunochromatographique |
| HBE_AG | Ag Hépatite B enveloppe (HBe) | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HBS_AG | Ag Hépatite B surface (HBs) | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| ADA (inclus dans AGVR) | Antigène Adénovirus respiratoire | Voies respiratoires | Détection qualitative par méthode d'immmunofluorescence directe avec Lecture en Microscopie à fluorescence |
| ASPA | Antigène Aspergillus (galactomannane) | Sang Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
Dosage quantitatif par méthode ELISA, analyseur Etimax 3000® (DiaSorin) |
| EHYS | Antigène Entamoeba histolytica | Selles | Méthode immunochromatographique |
| GIAR | Antigène Giardia lamblia | Selles | Méthode immunochromatographique |
| HPYA | Antigène Helicobacter pylori | Selles | Dosage qualitatif par méthode immunochromatographique |
| HS1, inclus dans AGHS | Antigène Herpes simplex 1 | Tractus urogénital-rectal > Prélèvement cervico-vaginal conventionnel Biopsie Frottis > Frottis divers |
Détection qualitative par méthode d'immunofluorescence directe avec Lecture en Microscopie à fluorescence |
| HS2, inclus dans AGHS | Antigène Herpes simplex 2 | Tractus urogénital-rectal > Prélèvement cervico-vaginal conventionnel Biopsie Frottis |
Détection qualitative par méthode d'immunofluorescence directe avec Lecture en Microscopie à fluorescence |
| LEGA | Antigène Legionella pneumophila (sérotype 1) | Urines | Détection qualitative par méthode immunochromatographique |
| AMPV (inclus dans AGVR) | Antigène Metapneumovirus | Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire Voies respiratoires > Nasopharynx Voies respiratoires |
Détection qualitative par méthode d'immmunofluorescence directe avec Lecture en Microscopie à fluorescence |
| NRV | Antigène Norovirus | Selles | Détection qualitative par méthode immunochromatographique (test rapide) |
| RTV | Antigène Rotavirus | Selles | Détection qualitative par méthode immunochromatographique |
| GDH | Antigène de Clostridium difficile (GDH) | Selles | Détection qualitative de l'antigène GDH de C.difficile par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON® (DiaSorin) |
| AGCR | Antigène de Cryptococcus neoformans | Liquides biologiques > LCR Sang Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
Dosage semi-quantitatif par méthode d'immunochromatographie |
| AIA, AIB (inclus dans AGVR) | Antigène influenza A et B | Voies respiratoires | Détection qualitative par méthode d'immunofluoresence directe avec Lecture en Microscopie à fluorescence |
| API (inclus dans AGVR) | Antigène parainfluenza 1,2,3 | Voies respiratoires | Détection qualitative par méthode d'immunofluoresence directe avec Lecture en Microscopie à fluorescence |
| PNEA | Antigène pneumocoque | Liquides biologiques > LCR Urines |
Détection qualitative par méthode immunochromatographique |
| RSV (inclus dans AGVR) | Antigène virus respiratoire syncytial (RSV) | Voies respiratoires | Détection qualitative par méthode d'immunofluoresence directe avec lecture en Microscopie à fluorescence - Trousses Light DiagnosticsTM Détection qualitative par méthode immunochromatographique - Trousse Binax® |
| CMV_AV | Avidité des IgG anti-CMV | Sang | dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| TOX_AV | Avidité des IgG anti-Toxoplasma | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| COVID_BAU_G-COVID_AU_G | COVID-19 IgG (Liaison XL) | Sang > Sang par ponction (hémoculture) | LiaisonXL |
| DENGR | Dépistage Dengue (Ag et Ac) | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunochromatographique |
| DM | EBV (Dépistage) | Sang | Détection qualitative par méthode immunochromatographique (technique manuelle), trousse Clearview® |
| EBV_G | EBV (IgG) | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| EBV_M | EBV (IgM) | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| ENTVA | Echovirus et coxsackies (IGA) | Sang | Dosage semi-quantitatif par méthode ELISA |
| ENTVG | Echovirus et coxsackies (IGG) | Sang | Dosage semi-quantitatif par méthode ELISA |
| ENHI | Entamoeba histolytica (amibiase) Anticorps | Sang > Sérum | Dosage quantitatif par méthode ELISA, analyseur Eti-max 3000® (DiaSorin) |
| CDIFP | PCR Toxines de Clostridium difficile | Selles | PCR en temps réel pour la détection simultanée des gènes codant la toxine B, la toxine binaire et la délétion en117 sur le gène tcdC (marqueur présomptif de la souche 027) |
| TRICOMBO (GIAR - EHYS - CRYPTO) | Panel Giardia lamblia - Entanoeba hystolytica - Cryptosporidium | Selles | Méthode EIA, automate Eti-max 3000 |
| TOXA | Recherche des toxines A et B du Clostridium difficile | Selles | Dosage qualitative par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON® (DiaSorin) |
| ECHINO_WB | Westernblot Echinococcus multilocularis | Sang | Détection qualitative par méthode d'Immuno-blot (technique manuelle) |
| GCH | anti- Bartonella henselae IgG | Sang | Dosage semi-quantitatif par méthode d'Immunofluorescence indirecte (technique manuelle) |
| GCHM | anti- Bartonella henselae IgM | Sang | Dosage semi-quantitatif par méthode d'Immunofluorescence indirecte (technique manuelle) |
| BOR_G, L_BOR | anti- Borrelia IgG | Liquides biologiques > LCR Sang |
Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON® XL (DiaSorin) |
| BORC_G | anti- Borrelia IgG confirmation | Liquides biologiques > LCR Sang |
Détection qualitative par méthode d'Immuno-dot (technique manuelle), trousse EuroImmun® |
| BOR_M | anti- Borrelia IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON® XL (DiaSorin) |
| BORC_M | anti- Borrelia IgM confirmation | Sang | Détection qualitative par méthode d'Immuno-dot (technique manuelle), trousse EuroImmun® |
| BRU_AG | anti- Brucella (Wright) | Sang | Dosage semi-quantitatif par méthode d'agglutination (technique manuelle), trousse BioRad® |
| CMV_G | anti- CMV IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| CMV_M | anti- CMV IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| CTR_A | anti- Chlamydia trachomatis IgA | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| CTR_G | anti- Chlamydia trachomatis IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| CPN_A | anti- Chlamydophila pneumoniae IgA | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| CPN_G | anti- Chlamydophila pneumoniae IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HIV | anti- HIV (Ag p24 + Ac anti-HIV1 et HIV2) | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HSV_G | anti- HSV 1/2 IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| HSV_M | anti- HSV 1/2 IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HTLV | anti- HTLV I et II | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| HCV | anti- Hépatite C | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| LEPT | anti- Leptospira | Sang | Dosage semi-quantitatif par méthode de Fixation du Complément (technique manuelle) |
| MYP_G | anti- Mycoplasma pneumoniae IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| MYP_M | anti- Mycoplasma pneumoniae IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| TOCA | anti- Toxocara canis | Sang | Dosage quantitatif par méthode ELISA, analyseur Eti-max 3000® (DiaSorin) |
| TOX_G | anti- Toxoplasma IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| TOX_M | anti- Toxoplasma IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| VZV_G | anti- VZV IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| VZV_M | anti- VZV IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| ADV_G | anti- adénovirus IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode ELISA sur Eti-max 3000® (DiaSorin) |
| HAV_M | anti- hépatite A IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HAV | anti- hépatite A totaux | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HBC | anti- hépatite B core (HBc) | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HBC_M | anti- hépatite B core (HBc) IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HBE | anti- hépatite B enveloppe (HBe) | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HBS_AC | anti- hépatite B surface (HBs) | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| IFA_A | anti- influenza A IgA | Sang | Dosage semi-quantitatif par méthode ELISA, analyseur Eti-max 3000® (DiaSorin) |
| IFA_G | anti- influenza A IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode ELISA, analyseur Eti-max 3000® (DiaSorin) |
| IFB_A | anti- influenza B IgA | Sang | Dosage semi-quantitatif par méthode ELISA,analyseur Eti-max 3000® (DiaSorin) |
| IFB_G | anti- influenza B IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode ELISA, analyseur Eti-max 3000® (DiaSorin) |
| ORE_G | anti- oreillons IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique sur l'analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| ORE_M | anti- oreillons IgM | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique sur l'analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| PI_A | anti- parainfluenza A IgA | Sang | Dosage semi-quantitatif par méthode ELISA, analyseur Eti-max 3000® (DiaSorin) |
| PI_G | anti- parainfluenza A IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode ELISA, analyseur Eti-max 3000® (DiaSorin) |
| P19_G | anti- parvovirus B19 IgG | Sang | Dosage semi-quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| P19_M | anti- parvovirus B19 IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON® XL(DiaSorin) |
| ROU_G | anti- rougeole IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique sur l'analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| ROU_M | anti- rougeole IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique sur l'analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| RUB_G | anti- rubéole IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| RUB_M | anti- rubéole IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| EM_EIA2 | anti-Echinococcus multilocularis | Sang | Dosage quantitatif par méthode ELISA sur Eti-max 3000® (DiaSorin) |
| HEVG | anti-HEV IgG | Sang | Dosage qualitatif analyseur VIDAS® (Biomérieux) |
| HEVM | anti-HEV IgM | Sang | Dosage qualitatif analyseur VIDAS® (Biomérieux) |
| LEGI | anti-Legionella pneumophila Ac totaux | Sang > Sérum | dosage semi-quantitatif par méthode d'Immunofluorescence indirecte (technique manuelle), trousse Meridian BioSciences® |
| TPSCR | anti-Treponema pallidum - dépistage spécifique | Sang | Dosage qualitatif (dosage combiné des IgM et des IgG anti-Treponema pallidum) par méthode immunoluminométrique |
| VDR, L_VDR | anti-Treponema pallidum non spécifique - RPR | Liquides biologiques > LCR Sang |
Dosage semi-quantitatif par méthode d'agglutination (technique manuelle) |
| TPH , L_TPH | anti-Treponema pallidum spécifique - TPHA | Liquides biologiques > LCR Sang |
Dosage semi-quantitatif par méthode d'agglutination (technique manuelle) |
| BDGLU | ß-Glucan | Sang | Détection quantitative du 1,3 béta-D-glucan sur l’automate Wako |
| Biologie Clinique > Site Notre-Dame des Bruyères | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| ABIT | Acides biliaires totaux | Sang Sang > Sang par ponction (hémoculture) |
Colorimétrique avec kit de réactifs Abbott sur ALINITY C |
| Biologie Clinique > Toxicologie clinique, médico-légale, de l'environnement et en entreprise | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| HEDIU | 2,5-Hexanedione urinaire | Urines | HPLC-DAD |
| 5FU-W | 5-Fluorouracil (Prélèvement de surface) | Tests d'environnement : Surface | LC-MSMS |
| OXU | Acide Oxalique urinaire | Urines | Spectrophotométrie |
| VAL | Acide Valproïque sanguin | Sang | PETINIA, Alinity, Abbott |
| ALAU | Acide delta-ALA-aminolévulinique urinaire | Urines | Spectrophotométrie |
| FORMU | Acide formique urinaire | Urines | HS-GC-FID |
| AHU | Acide hippurique urinaire (Métabolite du toluène) | Urines | HPLC-DAD |
| MANDU | Acide mandélique urinaire (Métabolite du styrène) | Urines | UPLC-DAD |
| MUCOU | Acide muconique urinaire (Métabolite du benzène) | Urines | UHPLC-MSMS |
| AMHU | Acide méthylhippurique urinaire (Métabolites du xylène) | Urines | UPLC-DAD |
| GLYU | Acide phénylglyoxylique urinaire (Métabolite du styrène) | Urines | UPLC/DAD |
| APMU | Acide phénylmercapturique dans l'urine (SPMA) | Urines | LC-MSMS |
| ATAU | Acide trichloroacétique urinaire | Urines | Spectrophotométrie |
| AEU | Actéone urinaire | Urines | HS-GC-FI |
| ACO | Acénocoumarol sanguin | Sang | LC-MSMS |
| AE | Acétone sanguine | Sang | HS-GC-FID |
| ALBEN | Albendazole sanguin | Sang | UHPLC-DAD |
| AL | Aluminium plasmatique | Sang | ICP-MS |
| ALU | Aluminium urinaire | Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| AM1 (amikacine vallée) // AM2 (amikacine pic) | Amikacine sanguin | Sang | PETINIA, Alinity, Abbott |
| ADM | Amiodarone sanguin | Sang | UPLC-DAD |
| AMPCHEV | Amphétamines (Cheveux) | Phanères et peau > Cheveux | LC-MSMS |
| AMPSAL | Amphétamines salivaire | Autres Types d'échantillons > Salive | LC-MSMS |
| SB | Antimoine sanguin | Sang | ICP-MS |
| SBU | Antimoine urinaire | Urines | ICP-MS |
| AS | Arsenic sanguin | Sang | ICP-MS |
| ASU | Arsenic urinaire | Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| BACLO | Baclofène sanguin | Sang | LC-MSMS |
| BPHO | Benzophénone-3 urinaire | Urines | LC-MSMS |
| BZ | Benzène sanguin | Sang | HS-GC-MS |
| BZU | Benzène urinaire | Urines | HS-GC-MS |
| BI | Bismuth sanguin | Sang | ICP-MS |
| BIU | Bismuth urinaire | Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| BPHA | Bisphénol A urinaire | Urines | GC-MSMS |
| BUPREN | Buprénorphine sanguine | Sang | UHPLC-MSMS |
| BUPRENU | Buprénorphine urinaire | Urines | UHPLC-MSMS |
| BER | Béryllium sanguin | Sang | ICP-MS |
| BERYU | Béryllium urinaire | Urines | ICP-MS |
| CAR | Bêta-Carotène plasmatique | Sang | HPLC-DAD |
| CD | Cadmium sanguin | Sang | ICP-MS |
| CDU | Cadmium urinaire | Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| CAE | Calcium érythrocytaire | Sang | ICP-MS |
| CANCHEV | Cannabis (Cheveux) | Phanères et peau > Cheveux | GC-MSMS |
| CANSAL | Cannabis salivaire | Autres Types d'échantillons > Salive | LC-MSMS |
| CAB | Carbamazépine sanguin | Sang | PETINIA, Alinity, Abbott |
| CATHIN | Cathine / Cathinone (Sang) | Sang | LC/MSMS |
| CATHU | Cathine / Cathinone (Urines) | Urines | LC/MSMS |
| CEFAZ | Cefazoline sanguine | Sang | HPLC-DAD |
| CEFTA | Ceftazidine sanguine | Sang | HPLC-DAD |
| CCL3 | Chloroforme sanguin | Sang | HS-GC-MS |
| CCL3U | Chloroforme urinaire | Urines | HS-GC-MS |
| CHRO | Chrome sanguin | Sang | ICP-MS |
| CHROU | Chrome urinaire | Urines > A jeun Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| CYC1 (temps 0) // CYC2 (temps 2H) | Ciclosporine sanguine | Sang | CMIA, Alinity, Abbott |
| CO | Cobalt sanguin | Sang | ICP-MS |
| COU | Cobalt urinaire | Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| COCCHEV | Cocaïne (Cheveux) | Phanères et peau > Cheveux | LC-MSMS |
| COCSAL | Cocaïne salivaire | Autres Types d'échantillons > Salive | LC-MSMS |
| CQ10 | Coenzyme Q10 plasmatique | Sang | HPLC-DAD |
| PERF | Composés perfluorés | Sang | LC-MSMS |
| ATU | Confirmation Antidépresseurs dans l'urine | Urines | UHPLC-TOFMS |
| COTU | Cotinine urinaire (Métabolite de la nicotine) | Urines | UHPLC-HR-TOF-MS |
| CU | Cuivre plasmatique | Sang | ICP-MS |
| CUU | Cuivre urinaire | Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| CY | Cyanures dans le sang | Sang | HPLC-Fluorimètre |
| CP_W | Cyclophosphamide (Prélèvement de surface) | Autre | LC-MSMS |
| CP_U | Cyclophosphamide urinaire | Urines | LC-MSMS |
| CEFU | Céfuroxime sanguine | Sang | HPLC-DAD |
| CEFE | Céfépime sanguine | Sang | HPLC-DAD |
| DCM | Dichlorométhane sanguin | Sang | HS-GC-MS |
| DCMU | Dichlorométhane urinaire | Urines | HS-GC-MS |
| DGO | Digoxine sanguin | Sang | PETINIA, Alinity, Abbott |
| DAMP / RAMP | Dosage / Recherche d'amphétamines dans le sang | Sang > Sérum | LC-MSMS |
| RAT / DAT | Dosage / Recherche d'antidépresseurs dans le sang | Sang | HPLC-DAD |
| DOP / ROP | Dosage / Recherche d'opiacés dans le sang | Sang | LC-MSMS |
| DBA / RBA | Dosage / Recherche de barbituriques dans le sang | Sang | GC-MS |
| DCAN / RCAN | Dosage / Recherche de cannabis dans le sang | Sang | LC-MSMS |
| DCOC / RCOC | Dosage / Recherche de cocaïne dans le sang | Sang | LC-MSMS |
| RNE / DNE | Dosage / Recherche de neuroleptiques dans le sang | Sang | HPLC-DAD |
| IAMPU | Dépistage d'Amphétamines dans l'urine | Urines | Immunoessai enzymatique, Alinity, Abbott |
| IATU | Dépistage d'Antidépresseurs tricycliques dans l'urine | Urines | Immunoessai enzymatique, Architect, Abbott |
| IAT | Dépistage d'Antidépresseurs tricycliques dans le sang | Sang | Immunoessai enzymatique, Alinity, Abbott |
| IOPU1 | Dépistage d'Opiacés dans l'urine | Urines | Immunoessai enzymatique, Alinity, Abbott |
| IOP1 | Dépistage d'Opiacés dans le sang | Sang | Immunoenzymatique, Alinity, Abbott |
| IBAU | Dépistage de Barbituriques dans l'urine | Sang | Immunoessai enzymatique, Architect, Abbott |
| IBA1 | Dépistage de Barbituriques dans le sang | Sang | Immunoessai enzymatique, Alinity, Abbott |
| IBEU1 | Dépistage de Benzodiazépines dans l'urine | Urines | Immunoessai enzymatique, Alinity, Abbott |
| IBE | Dépistage de Benzodiazépines dans le sang | Sang | Immunoessai enzymatique, Architect, Abbott |
| ICANU1 | Dépistage de Cannabinoïdes dans l'urine | Urines | Immunoessai enzymatique, Alinity, Abbott |
| ICOCU1 | Dépistage de Cocaïne dans l'urine | Urines | Immunoessai enzymatique, Alinity, Abbott |
| PL | Dérivés du Platine (Sang) | Sang | ICP-MS |
| SN | Etain sanguin | Sang | ICP-MS |
| SNU | Etain urinaire | Urines | ICP-MS |
| CETHA | Ethanol sanguin | Sang | HS-GC-FID |
| IETHA | Ethanol sanguin - méthode ADH | Sang | Enzymatique, Alinity, Abbott |
| CETHAU | Ethanol urinaire | Urines | HS-GC-FID |
| C | Ether sanguin | Sang | HS-GC-FID |
| ETGL | Ethylglucuronide sanguin | Sang | LC-MSMS |
| ETGLU | Ethylglucuronide urinaire | Urines | LC-MSMS |
| ETG | Ethylèneglycol sanguin | Sang | HS-GC-MS après extraction et dérivation |
| EVE | Evérolimus sanguin | Sang | LC-MSMS |
| FZ | Fluconazole sanguin | Sang | UPLC-DAD |
| FBAL-U | Fluoro-bêta-alabine urinaire (Métabolite du 5-Fluorouracil) | Urines | LC-MSMS |
| GHB | GHB sanguin | Sang | LC-MSMS |
| GHBU | GHB urinaire | Urines | LC-MSMS |
| TOCO | Gamma-Tocophérol plasmatique | Sang | HPLC-DAD |
| GE1 (Gentamicine vallée) // GE2 (Gentamicine pic) | Gentamicine sanguin | Sang | PETINIA, Alinity, Abbott |
| GLP_U | Glyphosate urinaire | Urines | LC/MSMS |
| OHCHLORO | Hydroxychloroquine sanguin | Sang | LC-MSMS |
| IMA | Imatinib sanguin | Sang | UHPLC-DAD |
| ISP | Isopropanol sanguin | Sang | HS-GC-FID |
| ISPU | Isopropanol urinaire | Urines | HS-GC-FID |
| ISOP | Isoprostane | Sang | Extraction solide/liquide ; LC-MS/MS |
| ISP | Isoprostane sanguin | Sang | LC-MSMS |
| IZ | Itraconazole sanguin | Sang | UPLC-DAD |
| KET | Kétamine sanguin | Sang | LC-MSMS |
| KETU | Kétamine urinaire | Urines | LC-MSMS |
| KZ | Kétoconazole sanguin | Sang | UPLC-DAD |
| LSD | LSD sanguin | Sang | LC-MSMS |
| LSDU | LSD urinaire | Urines | LC-MSMS |
| LTI | Lamotrigine sanguine | Sang | HPLC-DAD |
| LINE | Linézolide sanguin | Sang | HPLC-DAD |
| LIT | Lithium plasmatique | Sang | Colorimétrique, Alinity, Abbott |
| LIE | Lithium érythrocytaire | Sang | ICP-MS |
| LEVE | Lévétiracétam sanguin | Sang | HPLC-DAD |
| MCP | MCPP sanguin | Sang | LC/MSMS |
| MCPU | MCPP urinaire | Urines | LC/MSMS |
| MGE | Magnésium érythrocytaire | Sang | ICP-MS |
| MN | Manganèse sanguin | Sang | ICP-MS |
| MNU | Manganèse urinaire | Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| HG | Mercure sanguin | Sang | ICP-MS |
| HGU | Mercure urinaire | Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
FIMS |
| MZ | Miconazole sanguin | Sang | UPLC-DAD |
| MO | Molybdene sanguin | Sang | ICP-MS |
| MOU | Molybdene urinaire | Urines | ICP-MS |
| MONOXC | Monoxyde de carbone | Sang | HS-GC-BID |
| MONOXC_M | Monoxyde de carbone dans le muscle | Autre | HS-GC-BID |
| MPH | Mycophénolate plasmatique | Sang | HPLC-DAD |
| SCVU | Médicaments du système cardiovasculaire (Urines) | Urines | UHPLC-TOFMS |
| SCV | Médicaments du système cardiovasculaire (sang) | Sang | UHPLC-TOFMS |
| MERO | Méropénem sanguin | Sang | HPLC-DAD |
| HO-HAPU | Métabolites des HAPs (Urines) | Urines | GC-MSMS |
| METHA | Méthadone sanguine | Sang | HPLC-DAD |
| METHAU | Méthadone urinaire | Urines | UHPLC-TOFMS et UHPLC-MSMS |
| MET | Méthanol sanguin | Sang | HS-GC-FID |
| METU | Méthanol urinaire | Urines | HS-GC-FID |
| MTX | Méthotrexate sanguin | Sang | CMIA, Alinity, Abbott |
| MEC | Méthyléthylcétone sanguine | Sang | HS-GC-MS |
| MECU | Méthyléthylcétone urinaire | Urines | HS-GC-MS |
| NMFU | N-méthylformamide urinaire | Urines | GC-BID-MS |
| NI | Nickel sanguin | Sang | ICP-MS |
| NIU | Nickel urinaire | Urines | ICP-MS |
| NILO | Nilotinib sanguin | Sang | UHPLC-DAD |
| OPCHEV | Opiacés (Cheveux) | Phanères et peau > Cheveux | LC-MSMS |
| OPSAL | Opiacés salivaires | Autres Types d'échantillons > Salive | LC-MSMS |
| PCB | PCB sanguin | Sang | GC-MSMS |
| PARAB | Parabènes urinaires | Urines | LC-MSMS |
| CPARU | Paracétamol dans l'urine | Urines | UHPLC-TOFMS |
| PARA | Paracétamol dans le sang | Sang | Enzymatique, Alinity, Abbott |
| PEST | Pesticides organochlorés dans le sang | Sang | GC-MSMS |
| PESTOP | Pesticides organophosphorés dans l'urine (Métabolites dialkylphosphates) | Urines | GC-MSMS |
| PYR | Pesticides pyréthrinoïdes (Métabolites urinaires) | Urines | GC-MSMS |
| PHEN | Phencyclidine sanguin | Sang | UHPLC-TOFMS |
| PHENU | Phencyclidine urinaire | Urines | LC-MSMS |
| PHN | Phenprocoumone sanguin | Sang | LC-MSMS |
| PHO | Phenytoïne sanguine | Sang | Immunoenzymatique, Alinity, Abbott |
| PHTA | Phtalates (Métabolites urinaires) | Urines | LC-MSMS |
| PHL | Phénobarbital sanguin | Sang | PETINIA, Alinity, Abbott |
| PIPE | Pipéracilline sanguine | Sang | HPLC-DAD |
| PL_W | Platine (Prélèvement de surface) | Tests d'environnement : Surface | ICP-MS |
| PL_U | Platine urinaire | Urines | ICP-MS |
| PB | Plomb sanguin | Sang | ICP-MS |
| PBU | Plomb urinaire | Urines > A jeun Urines > 24H Urines |
ICP-MS |
| PZ | Posaconazole sanguin | Sang | UPLC-DAD |
| RBE / DBE | Recherche / Dosage de benzodiazépines dans le sang | Sang | HPLC-DAD |
| ATm | Recherche d'Antidépresseurs dans le méconium | Méconium | UHPLC-TOFMS |
| AMPU | Recherche d'amphétamines dans l'urine | Urines | LC-MSMS |
| AMPm | Recherche d'amphétamines dans le méconium | Méconium | LC-MSMS |
| OPU | Recherche d'opiacés dans l'urine | Urines | LC-MSMS |
| OPm | Recherche d'opiacés dans le méconium | Méconium | LC-MSMS |
| BEU | Recherche de Benzodiazépines dans l'urine | Urines | UHPLC-TOFMS |
| BEm | Recherche de Benzodiazépines dans le méconium | Méconium | UHPLC-TOFMS |
| CANPLAN | Recherche de Cannabinoïdes dans les plants | Autres Types d'échantillons > Plantes-Résines-Herbes | UHPLC-DAD |
| NEU | Recherche de Neuroleptiques dans l'urine | Urines | UHPLC-TOFMS |
| NEm | Recherche de Neuroleptiques dans le Méconium | Méconium | UHPLC-TOFMS |
| BAU | Recherche de barbituriques dans l'urine | Urines | GC-MS |
| BALG | Recherche de barbituriques dans le liquide gastrique | Liquides biologiques > Liquide gastrique | HPLC-DAD |
| RBA | Recherche de barbituriques dans le sang | Sang | GC-MS |
| CANU | Recherche de cannabis dans l'urine | Urines | LC-MSMS |
| CANm | Recherche de cannabis dans le méconium | Méconium | LC-MSMS |
| COCU | Recherche de cocaïne dans l'urine | Urines | LC-MSMS |
| COCm | Recherche de cocaïne dans le méconium | Méconium | LC-MSMS |
| MPU | Recherche de méprobamate dans l'urine | Urines | UHPLC-TOFMS |
| RMP/DMP | Recherche/Dosage de méprobamate (Sang) | Sang | UHPLC/TOF MS |
| PBDE | Retardateurs de flamme bromés dans le sang | Sang | GC-MSMS |
| SAL | Salicylés sanguin | Sang | Enzymatique, Alinity, Abbott |
| SALU | Salicylés urinaire | Urines | Enzymatique, Alinity, Abbott |
| SIR | Sirolimus sanguin | Sang | CMIA, Alinity, Abbott |
| SR | Strontium sanguin | Sang | ICP-MS |
| HYPOG | Sulfamidés hypoglycémiants sanguin | Sang | LC-MSMS |
| SE | Sélénium plasmatique | Sang | ICP-MS |
| SEU | Sélénium urinaire | Urines | ICP-MS |
| TCPY | TCPY urinaire (Métabolite du chlorpyrifos) | Urines | GC-MSMS |
| TAR | Tacrolimus sanguin | Sang | CMIA, Alinity, Abbott |
| TEI | Teicoplanine sanguine | Sang | HPLC-DAD |
| TL | Thallium sanguin | Sang | ICP-MS |
| TLU | Thallium urinaire | Urines > A jeun Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| SCYU | Thiocyanate urinaire | Urines | HPLC-FLUO |
| SCY | Thiocyanates sanguin | Sang | Spectrophotométrie |
| TPE | Thiopental sanguin | Sang | HPLC-DAD |
| THE | Théophylline sanguin | Sang | Immunoenzymatique, Alinity, Abbott |
| TOL | Toluène sanguin | Sang | HS-GC-MS |
| TOLU | Toluène urinaire | Urines | HS-GC-MS |
| TRAM | Tramadol dans le sang | Sang | HPLC-Fluorimètre |
| TCA | Trichloroéthane | Sang | HS-GC-MS |
| TCAU | Trichloroéthane urinaire | Urines | HS-GC-MS |
| TCEU | Trichloroéthanol urinaire | Urines | Spectrophotométrie |
| TCY | Trichloroéthylène sanguin | Sang | HS-GC-MS |
| TCYU | Trichloroéthylène urinaire | Urines | HS-GC-FID |
| TRICLO | Triclosan urinaire | Urines | GC-MSMS |
| TEMOL | Témocilline libre sanguine | Sang | LC-MSMS |
| TEMOT | Témocilline totale sanguine | Sang | LC-MSMS |
| 4C | Tétrachlorure de carbone sanguin | Sang | HS-GC-MS |
| 4CU | Tétrachlorure de carbone urinaire | Urines | HS-GC-MS |
| VA | Vanadium sanguin | Sang | ICP-MS |
| VU | Vanadium urinaire | Urines > A jeun Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| VA1 | Vancomycine sanguine | Sang | PETINIA, Alinity, Abbott |
| VIA | Vitamine A (Rétinol) plasmatique | Sang | HPLC-DAD |
| VITC | Vitamine C dans le sang | Sang | HPLC-DAD |
| VIE | Vitamine E (Alpha-Tocophérol) plasmatique | Sang | HPLC-DAD |
| VZ | Voriconazole sanguin | Sang | UPLC-DAD |
| WARF | Warfarine sanguin | Sang | LC-MSMS |
| ZN | Zinc plasmatique | Sang | ICP-MS |
| ZNU | Zinc urinaire | Urines > A jeun Urines > 24H Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
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Sortie Excel
