• Accréditation
  • Discipline
  • Nature de l'échantillon
  • Réalisable en urgence



Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Streptocoques
Code EssaiPropriété mesuréeEchantillonMéthode et appareil
MIC-CNR-GBS5 Détermination des sérotypes capsulaires de S.agalactiae Culture > Streptococcus agalactiae
Culture

Détection des polysaccharides capsulaires (Ia, Ib, II à IX) de S.agalactiae par un test d'agglutination avec des particules de latex spécifiques des différents sérotypes

MIC-CNR-VIB4 Détermination du sérogroupe et serovar de V.cholerae Culture

Détection des antigènes O de V.cholerae par un test d'agglutination rapide sur lame avec des antisera spécifiques de V.cholerae.
Le choix des antisera utilisés permet de différencier V.cholerae O1 serovar Inaba, V.cholerae O1 serovar Ogawa, V.cholerae O1 serovar Hikojima et V.cholerae O139 Bengal

HEPID HELICOBACTER PYLORI - Recherche d'Helicobacter pylori par culture Autre

Mise en culture d'un broyat de la biopsie sur milieu sélectif approprié.
Incubation: 3 à 10 jours à 35 +/-1°C, en microaérophilie.

MIC-CNR-GBS3 Identification de S. agalactiae par agglutination Culture > Streptococcus agalactiae
Culture

Détection de l'antigène de groupe B par un test d'agglutination'avec des particules de latex spécifiques du groupe B

MIC-CNR-VIB3 Identification par détermination du profil des protéines ribosamales Culture

Spectrométrie de masse MALDI-TOF

MIC-CNR-GBS4 Identification par détermination du profil des protéines ribosomales Culture > Streptococcus agalactiae
Culture

Spectrométrie de masse MALDI-TOF

MIC-CNR-GBS1 Recherche de S.agalactiae par culture après enrichissement sélectif Frottis > Frottis vaginal
Frottis > Frottis rectal

Culture sur milieux sélectifs et différentiels appropriés y compris un bouillon d'enrichissement sélectif. Incubation à 35°C dans les atmosphères appropriées (air, air + CO2 et anaérobiose)

TDRHP Recherche par PCR de la présence des gènes TDH/TRH Vibrio parahaemoliticus Culture > Vibrio sp

PCR

MIC-CNR-VIB5 Recherche par PCR de la présence du gène CtxA, marqueur de pathogénicité codant pour la sous-unité A de la toxine cholérique Culture

Détection du gène CtxA par PCR "in house" en temps réel adaptée d'après l'article "Use of real time PCR assay for detection of the CtXA gene of Vibrio Cholerae in an environmental survey of mobile bay" (Blackstone G. et al., Journal of Microbiological Methods, 2007)


Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Laboratoire de Référence SIDA > LRS : Biologie Moléculaire
Code EssaiPropriété mesuréeEchantillonMéthode et appareil
LRS_HIV_PCR Détection de l'ADN proviral HIV-1 dans les PBMC Sang

Détection par PCR. Test "home-made".

LRS_HIV_GENO Génotypage HIV Sang > Plasma EDTA

Séquençage des gène Reverse Transcriptase, Protease et Integrase

LRS_HCV_GENO Test de génotypage LIPA VERSANT HCV (SIEMENS) Sang

Amplification de l'ARN viral par PCR après extraction manuelle (QIAGEN) et détermination des génotypes (de 1 à 6) et sous-types par hybridation inverse sur bandelettes

LRS_HBV_QUA Test de quantification de l'ADN viral HBV plasmatique Sang

Extraction automatisée des échantillons (m2000sp, Abbott) suivie d'une amplification et d'une quantification par PCR en temps réel (m2000rt, Abbott)

LRS_HCVQUAm2000RT Test de quantification de l'ARN viral HCV plasmatique Sang

Extraction automatisée des échantillons (m2000sp, Abbott) suivie d'une amplification et d'une quantification par RT-PCR en temps réel (m2000rt, Abbott)

HIVP_COB Test de quantification de l'ARN viral HIV-1 plasmatique Sang

Extraction automatisée des échantillons suivie d'une amplification et d'une quantification par PCR en temps réel (c6800, Roche)

LRS_HCVCALm2000RT Test qualitatif de détection de l'ARN viral HCV plasmatique Sang

Extraction automatisée des échantillons (m2000sp, Abbott) suivie d'une amplification et d'une détection par RT-PCR en temps réel (m2000rt, Abbott)


Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Laboratoire de Référence SIDA > LRS : Sérologie
Code EssaiPropriété mesuréeEchantillonMéthode et appareil
LRS_VIDAS_DUO Test de détection de l'Ag p24 de HIV-1 et des Ac anti-HIV-1/HIV-2 dans le sang Sang

ELFA (Enzyme Linked Fluorescent Assay, Biomerieux) réalisé sur VIDAS

LRS_GENS_HIV Test qualitatif de détection d'anticorps anti-HIV1 et -HIV2 Sang

EIA réalisé avec le test GENSCREEN HIV1/2 (v.02) (BIORAD)

LRS_LIA_HIV Test qualitatif de détection d’anticorps dirigés contre le virus de l’immunodéficience humaine (HIV) de types 1 et 2 dans le sang Sang

Immunoblot sur bandelettes réalisé sur AUTO-LIA (Innogenetics)

LRS_VIDAS_AGP24 Test quantitatif de détection de l'Ag p24 de HIV-1 dans le sang Sang

ELFA (Enzyme Linked Fluorescent Assay, Biomerieux) réalisé sur VIDAS


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