- Accréditation
- Discipline
- Nature de l'échantillon
- Réalisable en urgence
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Mycoses | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| MIC-CNR-MYC6 | Identification microscopique | Culture | Examen microscopique après croissance sur des milieux appropriés |
| MIC-CNR-MYC4 | Identification par détermination du profil des protéines ribosomales | Culture | Spectrométrie de masse MALDI-TOF |
| MIC-CNR-MYC7 | Identification par séquençage de la portion ITS | Culture > Levures Culture > Champignons filamenteux Tissus frais |
Technique d'amplification par PCR d'un fragment ITS permettant l'identification de l'agent fongique étudié et la discrimination entre espèces proches phylogénétiquement. |
| MIC-CNR-MYC3 | Recherche de champignons filamenteux par culture | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Ongles Phanères et peau > Squames Phanères et peau |
Mise en culture avec isolement sur des milieux spécifiques et incubation en aérobiose |
| MIC-CNR-MYC2 | Recherche de levures par culture | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Ongles Phanères et peau > Squames |
Mise en culture avec isolement sur des milieux spécifiques et incubation en aérobiose |
| MIC-CNR-MYC8 | Sensibilité aux antifongiques: détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI en mg/L) par méthode de dilution en milieu liquide et interprétation | Culture > Levures | Technique quantitative standardisée de détermination de CMI en microdilution par l'utilisation de microplaque SENSITITRE. Les suspensions standardisées de levures sont distribuées dans les microplaques à l'aide de l'autoinoculateur sensititre. Après incubation, les CMI sont lues à l'aide du système Sensititre VIZION et interprétées en catégories S (Sensible), I (Intermédiaire) et R (Résistant) en accord avec l'édition la plus récente du CLSI (Clinical Laboartory Standards Institute) |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Streptocoques | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| MIC-CNR-GBS2 | Culture | Culture | Culture sur milieux solides nutritifs ou différentiels ou en bouil'on suivant les objectifs poursuivis |
| MIC-CNR-GBS7 | Détermination de la sensibilité aux agents antimicrobiens | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Plusieurs méthodes peuvent être utilisées isolément ou en combinaison: -Détermination des concentrations minimales (CMI en mg/L) par la micro-méthode en dilution: Sensititre Trek et interpretation -Détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI en mg/L) par la méthode en dilution ETest et interprétation -Détermination de la résistance inductible à la clindamycine par la méthode de diffusion de disques en milieu gélosé |
| MIC-CNR-GBS6 | Détermination des caractéristiques microscopiques après coloration de Gram | Culture > Bactéries Culture |
Examen microscopique après coloration de Gram d'un étalement de la souche cultivée et description de la morphologie / coloration des bactéries observées |
| MIC-CNR-GBS5 | Détermination des sérotypes capsulaires de S.agalactiae | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Détection des polysaccharides capsulaires (Ia, Ib, II à IX) de S.agalactiae par un test d'agglutination avec des particules de latex spécifiques des différents sérotypes |
| MIC-CNR-GBS3 | Identification de S. agalactiae par agglutination | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Détection de l'antigène de groupe B par un test d'agglutination'avec des particules de latex spécifiques du groupe B |
| MIC-CNR-GBS4 | Identification par détermination du profil des protéines ribosomales | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Spectrométrie de masse MALDI-TOF |
| MIC-CNR-GBS1 | Recherche de S.agalactiae par culture après enrichissement sélectif | Frottis > Frottis vaginal Frottis > Frottis rectal |
Culture sur milieux sélectifs et différentiels appropriés y compris un bouillon d'enrichissement sélectif. Incubation à 35°C dans les atmosphères appropriées (air, air + CO2 et anaérobiose) |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Vibrios | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| MIC-CNR-VIB1 | Culture | Culture | Culture sur milieux solides nutritifs |
| MIC-CNR-VIB4 | Détermination du sérogroupe et serovar de V.cholerae | Culture | Détection des antigènes O de V.cholerae par un test d'agglutination rapide sur lame avec des antisera spécifiques de V.cholerae. |
| MIC-CNR-VIB3 | Identification par détermination du profil des protéines ribosamales | Culture | Spectrométrie de masse MALDI-TOF |
| TDRHP | Recherche par PCR de la présence des gènes TDH/TRH Vibrio parahaemoliticus | Culture > Vibrio sp | PCR |
| MIC-CNR-VIB5 | Recherche par PCR de la présence du gène CtxA, marqueur de pathogénicité codant pour la sous-unité A de la toxine cholérique | Culture | Détection du gène CtxA par PCR "in house" en temps réel adaptée d'après l'article "Use of real time PCR assay for detection of the CtXA gene of Vibrio Cholerae in an environmental survey of mobile bay" (Blackstone G. et al., Journal of Microbiological Methods, 2007) |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Laboratoire de Référence SIDA > LRS : Biologie Moléculaire | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| LRS_HIV_PCR | Détection de l'ADN proviral HIV-1 dans les PBMC | Sang | Détection par PCR. Test "home-made". |
| LRS_HCV_GENO | Test de génotypage LIPA VERSANT HCV (SIEMENS) | Sang | Amplification de l'ARN viral par PCR après extraction manuelle (QIAGEN) et détermination des génotypes (de 1 à 6) et sous-types par hybridation inverse sur bandelettes |
| LRS_HBV_QUA | Test de quantification de l'ADN viral HBV plasmatique | Sang | Extraction automatisée des échantillons (m2000sp, Abbott) suivie d'une amplification et d'une quantification par PCR en temps réel (m2000rt, Abbott) |
| LRS_HCVQUAm2000RT | Test de quantification de l'ARN viral HCV plasmatique | Sang | Extraction automatisée des échantillons (m2000sp, Abbott) suivie d'une amplification et d'une quantification par RT-PCR en temps réel (m2000rt, Abbott) |
| HIVP_COB | Test de quantification de l'ARN viral HIV-1 plasmatique | Sang | Extraction automatisée des échantillons suivie d'une amplification et d'une quantification par PCR en temps réel (c6800, Roche) |
| LRS_HCVCALm2000RT | Test qualitatif de détection de l'ARN viral HCV plasmatique | Sang | Extraction automatisée des échantillons (m2000sp, Abbott) suivie d'une amplification et d'une détection par RT-PCR en temps réel (m2000rt, Abbott) |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Laboratoire de Référence SIDA > LRS : Sérologie | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| LRS_VIDAS_DUO | Test de détection de l'Ag p24 de HIV-1 et des Ac anti-HIV-1/HIV-2 dans le sang | Sang > Plasma EDTA Sang > Sérum |
ELFA (Enzyme Linked Fluorescent Assay, Biomerieux) réalisé sur VIDAS |
| LRS_GENS_HIV | Test qualitatif de détection d'anticorps anti-HIV1 et -HIV2 | Sang > Plasma EDTA Sang > Sérum |
EIA réalisé avec le test GENSCREEN HIV1/2 (v.02) (BIORAD) |
| LRS_LIA_HIV | Test qualitatif de détection d’anticorps dirigés contre le virus de l’immunodéficience humaine (HIV) de types 1 et 2 dans le sang | Sang | Immunoblot sur bandelettes réalisé sur AUTO-LIA (Innogenetics) |
| LRS_VIDAS_AGP24 | Test quantitatif de détection de l'Ag p24 de HIV-1 dans le sang | Sang | ELFA (Enzyme Linked Fluorescent Assay, Biomerieux) réalisé sur VIDAS |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Sérologie Infectieuse | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| HBE_AG | Ag Hépatite B enveloppe (HBe) | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HBS_AG | Ag Hépatite B surface (HBs) | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| CMV_G | anti- CMV IgG | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| CMV_M | anti- CMV IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HIV | anti- HIV (Ag p24 + Ac anti-HIV1 et HIV2) | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HTLV | anti- HTLV I et II | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON®XL (DiaSorin) |
| HCV | anti- Hépatite C | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HBC | anti- hépatite B core (HBc) | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HBC_M | anti- hépatite B core (HBc) IgM | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HBE | anti- hépatite B enveloppe (HBe) | Sang | Dosage qualitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| HBS_AC | anti- hépatite B surface (HBs) | Sang | Dosage quantitatif par méthode immunoluminométrique, analyseur LIAISON XL® (DiaSorin) |
| TPSCR | anti-Treponema pallidum - dépistage spécifique | Sang | Dosage qualitatif (dosage combiné des IgM et des IgG anti-Treponema pallidum) par méthode immunoluminométrique |
| Biologie Clinique > Toxicologie clinique, médico-légale, de l'environnement et en entreprise | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| VAL | Acide Valproïque sanguin | Sang | PETINIA, Alinity, Abbott |
| AL | Aluminium plasmatique | Sang | ICP-MS |
| AM1 (amikacine vallée) // AM2 (amikacine pic) | Amikacine sanguin | Sang | PETINIA, Alinity, Abbott |
| SB | Antimoine sanguin | Sang | ICP-MS |
| SBU | Antimoine urinaire | Urines | ICP-MS |
| AS | Arsenic sanguin | Sang | ICP-MS |
| ASU | Arsenic urinaire | Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| BI | Bismuth sanguin | Sang | ICP-MS |
| BIU | Bismuth urinaire | Urines > 24H Urines Urines > Non déterminé (Autre) |
ICP-MS |
| BER | Béryllium sanguin | Sang | ICP-MS |
Sortie Excel
