- Accréditation
- Discipline
- Nature de l'échantillon
- Réalisable en urgence
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Biologie Moléculaire | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| TOXOP | Détection qualitiative par PCR en temps réel de Toxoplasma sp | Sang Liquides biologiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temsp réel "in house" ciblée sur une séquence répétée non codante (529pb) de Toxoplasma gondii, ABI 7500 (Applied Biosystems) |
| VZVP | Détection qualitiative par PCR en temps réel du virus de la Varicelle et du Zona (VZV) | Liquides biologiques > LCR Frottis > Frottis divers |
PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène ORF21, du VZV, Lightcycler 480 (Roche) |
| BKVP | Détection quantitative par PCR en temps réel du BK Polyomavirus | Sang Urines |
PCR en temps réel quantitative, Lightcyler 480 (Roche) |
| HSVP | PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour la glycoprotéine D de HSV 1 et 2, ABI 7500 (Applied Biosystems) | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Liquides biologiques > Liquide de ponction divers Biopsie Frottis > Frottis divers |
Détection qualitative par PCR en temps réel "home made" des virus Herpes Simplex 1 et 2 (HSV1 et HSV2) |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Mycoses | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| MIC-CNR-MYC1 | Examen microscopique pour la détection de la présence de levures, spores et filaments mycéliens | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Ongles Phanères et peau > Squames |
Examen microscopique après coloration au blanc de calcofluor |
| MIC-CNR-MYC6 | Identification microscopique | Culture | Examen microscopique après croissance sur des milieux appropriés |
| MIC-CNR-MYC4 | Identification par détermination du profil des protéines ribosomales | Culture | Spectrométrie de masse MALDI-TOF |
| MIC-CNR-MYC7 | Identification par séquençage de la portion ITS | Culture > Levures Culture > Champignons filamenteux Tissus frais |
Technique d'amplification par PCR d'un fragment ITS permettant l'identification de l'agent fongique étudié et la discrimination entre espèces proches phylogénétiquement. |
| MIC-CNR-MYC3 | Recherche de champignons filamenteux par culture | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Ongles Phanères et peau > Squames Phanères et peau |
Mise en culture avec isolement sur des milieux spécifiques et incubation en aérobiose |
| MIC-CNR-MYC2 | Recherche de levures par culture | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Ongles Phanères et peau > Squames |
Mise en culture avec isolement sur des milieux spécifiques et incubation en aérobiose |
| MIC-CNR-MYC8 | Sensibilité aux antifongiques: détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI en mg/L) par méthode de dilution en milieu liquide et interprétation | Culture > Levures | Technique quantitative standardisée de détermination de CMI en microdilution par l'utilisation de microplaque SENSITITRE. Les suspensions standardisées de levures sont distribuées dans les microplaques à l'aide de l'autoinoculateur sensititre. Après incubation, les CMI sont lues à l'aide du système Sensititre VIZION et interprétées en catégories S (Sensible), I (Intermédiaire) et R (Résistant) en accord avec l'édition la plus récente du CLSI (Clinical Laboartory Standards Institute) |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Streptocoques | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| MIC-CNR-GBS2 | Culture | Culture | Culture sur milieux solides nutritifs ou différentiels ou en bouil'on suivant les objectifs poursuivis |
| MIC-CNR-VIB1 | Culture | Culture | Culture sur milieux solides nutritifs |
| MIC-CNR-GBS7 | Détermination de la sensibilité aux agents antimicrobiens | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Plusieurs méthodes peuvent être utilisées isolément ou en combinaison: -Détermination des concentrations minimales (CMI en mg/L) par la micro-méthode en dilution: Sensititre Trek et interpretation -Détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI en mg/L) par la méthode en dilution ETest et interprétation -Détermination de la résistance inductible à la clindamycine par la méthode de diffusion de disques en milieu gélosé |
| MIC-CNR-GBS6 | Détermination des caractéristiques microscopiques après coloration de Gram | Culture > Bactéries Culture |
Examen microscopique après coloration de Gram d'un étalement de la souche cultivée et description de la morphologie / coloration des bactéries observées |
| MIC-CNR-GBS5 | Détermination des sérotypes capsulaires de S.agalactiae | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Détection des polysaccharides capsulaires (Ia, Ib, II à IX) de S.agalactiae par un test d'agglutination avec des particules de latex spécifiques des différents sérotypes |
| MIC-CNR-VIB4 | Détermination du sérogroupe et serovar de V.cholerae | Culture | Détection des antigènes O de V.cholerae par un test d'agglutination rapide sur lame avec des antisera spécifiques de V.cholerae. |
| MIC-CNR-GBS3 | Identification de S. agalactiae par agglutination | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Détection de l'antigène de groupe B par un test d'agglutination'avec des particules de latex spécifiques du groupe B |
| MIC-CNR-VIB3 | Identification par détermination du profil des protéines ribosamales | Culture | Spectrométrie de masse MALDI-TOF |
| MIC-CNR-GBS4 | Identification par détermination du profil des protéines ribosomales | Culture > Streptococcus agalactiae Culture |
Spectrométrie de masse MALDI-TOF |
Sortie Excel
