- Accréditation
- Discipline
- Nature de l'échantillon
- Réalisable en urgence
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Biologie Moléculaire | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| TOXOP | Détection qualitiative par PCR en temps réel de Toxoplasma sp | Sang Liquides biologiques Voies respiratoires > Lavage broncho-alvéolaire |
PCR qualitative en temsp réel "in house" ciblée sur une séquence répétée non codante (529pb) de Toxoplasma gondii, ABI 7500 (Applied Biosystems) |
| VZVP | Détection qualitiative par PCR en temps réel du virus de la Varicelle et du Zona (VZV) | Liquides biologiques > LCR Frottis > Frottis divers |
PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène ORF21, du VZV, Lightcycler 480 (Roche) |
| BKVP | Détection quantitative par PCR en temps réel du BK Polyomavirus | Sang Urines |
PCR en temps réel quantitative, Lightcyler 480 (Roche) |
| HSVP | PCR qualitative en temps réel "in house" ciblée sur le gène codant pour la glycoprotéine D de HSV 1 et 2, ABI 7500 (Applied Biosystems) | Voies respiratoires > Aspirations trachéo-bronchiques Liquides biologiques > Liquide de ponction divers Biopsie Frottis > Frottis divers |
Détection qualitative par PCR en temps réel "home made" des virus Herpes Simplex 1 et 2 (HSV1 et HSV2) |
| Biologie Clinique > Microbiologie Clinique > Centres Nationaux de Référence > Mycoses | |||
| Code Essai | Propriété mesurée | Echantillon | Méthode et appareil |
| MIC-CNR-MYC1 | Examen microscopique pour la détection de la présence de levures, spores et filaments mycéliens | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Ongles Phanères et peau > Squames |
Examen microscopique après coloration au blanc de calcofluor |
| MIC-CNR-MYC6 | Identification microscopique | Culture | Examen microscopique après croissance sur des milieux appropriés |
| MIC-CNR-MYC4 | Identification par détermination du profil des protéines ribosomales | Culture | Spectrométrie de masse MALDI-TOF |
| MIC-CNR-MYC7 | Identification par séquençage de la portion ITS | Culture > Levures Culture > Champignons filamenteux Tissus frais |
Technique d'amplification par PCR d'un fragment ITS permettant l'identification de l'agent fongique étudié et la discrimination entre espèces proches phylogénétiquement. |
| MIC-CNR-MYC3 | Recherche de champignons filamenteux par culture | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Ongles Phanères et peau > Squames Phanères et peau |
Mise en culture avec isolement sur des milieux spécifiques et incubation en aérobiose |
| MIC-CNR-MYC2 | Recherche de levures par culture | Phanères et peau > Cheveux Phanères et peau > Ongles Phanères et peau > Squames |
Mise en culture avec isolement sur des milieux spécifiques et incubation en aérobiose |
Sortie Excel
