Identification par séquençage de la portion ITS |
Code ESSAI: MIC-CNR-MYC7 |
Test Accrédité | ISO 15189 |
Réalisable en urgence | oui |
Formulaire de demande | MQ.A11.45 - formulaire mycoses - FR, MQ.A11.46 - NRC mycosen - NL |
Pré-analytique |
Type d'échantillons | Culture > Levures, Culture > Champignons filamenteux, Tissus frais |
Autre type d'échantillons |
Prélèvements de LBA, biopsies fraiches et en paraffine dont l'examen microscopique montre la présence de filaments mycéliens.
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Matériels | Récipient stérile |
Conditions de collecte, traitement, conservation et transport |
Pour biopsie, transport à température ambiante si moins de 2 jours, sinon transport frigorifique.
Pour les souches, transport à T ° ambiante sur milieu Sabouraud ou autre milieu approprié.
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Analytique |
Méthode et appareil |
Technique d'amplification par PCR d'un fragment ITS permettant l'identification de l'agent fongique étudié et la discrimination entre espèces proches phylogénétiquement.
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Kit |
Thermocycler. Extracteur d'acides nucléiques Maxwell. Séquenceur ABI.
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Post-analytique |
Délais |
21 jours (max)
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Fréquence de réalisation de l'analyse |
1 fois par jour (5jours sur 7)
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