Biologie Moléculaire Hématologique (BMH)/Génétique moléculaire des Cancers

Chef de laboratoire

Dr Frédéric LAMBERT

Téléphone

04/366.24.78 ou 25.61

Fax

04/366.29.74

EMail

dispa.genetique@chuliege.be

Discipline

Génétique
> Biologie Moléculaire Hématologique

Panel Maladies Hématologiques héréditaires Whole Exome Sequencing Code ESSAI: NGS_WES_Hémato_Héréditaire
Test AccréditéISO 15189
Réalisable en urgencenon
Pré-analytique
Type d'échantillonsAutres Types d'échantillons > ADN, Moëlle hématopoïétique
Autre type d'échantillons

ADN génomique

MatérielsTube EDTA (bouchon mauve) 10mL
Conditions de collecte, traitement, conservation et transport

Conservation :

  • Moëlle, sang sur tube EDTA stocké à 2-8°C. 
  • ADNg stocké entre -15 et -25°C. 
Analytique
Méthode et appareil

Séquençage haut débit (Whole Exome Sequencing) 

Kit

Agilent SureSelect Human All Exon V6

Post-analytique
Intervalles de référence

Gene list :

ANKRD26, ATG2B, ATM, ATR, ATRX, BLM, BRCA1, BRCA2(FANCD1), CBL, CEBPA, CHEK2, CSF3R, CTC1, DDX41, DKC1, DNAJC21, EGLN1, ELANE, EPAS1, EPO, EPOR, ERCC6L2, ETV6, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCJ, FANCL, FANCM, FANCN, FANCO, FANCP, FANCQ, FANCR, FANCS, FANCU, FANCV, G6PC3, GATA2, GFI1, GSKIP, HAX1, JAK2, KRAS, LIG4, , MECOM, MLH1, MPL, MSH2, MSH6, NBN, NF1, NHP2, NOP10, PARN, PAX5, PMS2, PTPN11, RBM8A, RPL1, RPL35A, RPL5, RPS10, RPS19, RPS24, RPS26, RPS7, RTEL1, RTEL1, RUNX1, SAMD9, SAMD9L, SBDS, SBF2, SHQ, SRP54, , SRP72, STN1, TERC, TERT, TET2, THPO, TINF2, TP53, TPP1, UBE2T, USB1, VHL, VPS45, WAS, WRAP53

UTRs/deep intronic regions : 

ANKRD26 (10:27389256-27389427) ; DKC1 (X:153991031-153991240)      TERC (3:169482849-169483098) ; RTEL1 (20:62326911 ; 20:62326972 ; 20:62326914).

Expression du Résultat

Les mutations sont nommées suivant la nomenclature HGVS et rapportés suivant la classification ACMG.

Délais (sauf le week-end) 93 jours (max)
Fréquence de réalisation de l'analyse Uniquement sur rendez-vous
Nomenclature INAMI
Code INAMI565493 - 565504 - 565552 - 565563
Règles INAMI

Article 33. Pour plus d'informations (Détail, règles, etc.), cliquez sur le code INAMI. 

Intérêt scientifique
Intérêt médical et scientifique

Les pathologies hématologiques congénitales forment un groupe hétérogène de pathologies toujours pas complètement connues et en constante évolution.

Le nombre d´analyses pour des patients souffrants, ou suspects de porter des pathologies hématologiques congénitales n´n’est toujours pas adéquat et parfois limité, en terme de nombre des gènes interrogés (analyses ciblés à quelques gènes).

En effet, les syndromes myélodysplasiques et la leucémie aigüe sont des groups de pathologies hématologiques génétiquement hétérogènes et présentant des formes cliniques diverses. Des variant pathogéniques dans un seul gène peuvent prédisposer aux porteurs d´un risque accru de développer des syndromes myélodysplasiques primaires et /ou des leucémies aigues.

Ces SMD/LA peuvent apparaitre dans un contexte de SMD/AL familial présentant des phénotypes clairement SMD/AL, ou alors apparaitre ou se développer à partir d´autres iinsuffisances médullaires héréditaires (IBMFS) tels que les anémie de Fanconi ou de Diamond Blackfan, la Dyskératose congénitale ou des neutropénies congénitales sévères.

L’objectif de cette analyse est d´offrir une méthode analytique fermentant l´analyse d´une vaste gamme de pathologies hématologiques héréditaire liées à des syndromes myélodysplasiques ou leucémie aigues. La littérature scientifique suggère que +-85% des mutations responsables des maladies mendéliennes se trouvent dans l´exome, ce qui justifie donc l´approche Whole Exome Sequencing, permettant de séquencer rapidement les parties codantes des gènes impliqués dans ces pathologies.

Publications / références
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